末来人类灭绝的上亿年之后，一片叫特洛依的大陆生存着高智商高科技的神民，在他们获得了永生之后离开了这片富庶的国度。几个世纪后，大陆上的人族、魔族、兽族和机械体开始追寻神民的足迹，之间也暴发了接连不断的战争。
在人类的集聚地多罗多岛，大王子继承了王位后，二王子法哈帝开始起兵谋反，并将这个岛屿一分为二，建立了第四帝国，同时军师哈普古德离开了宫廷。有一天近卫队长京接到了法哈帝刺杀军师的密令，开始了与梦想背道而驰的一生。
第一章：背叛
京和父亲我龙应召去大殿见到法哈帝，讨论有关哈普古德要投靠法利鲁的事，法哈帝派他们去规劝恩师，领命后两人在大殿两侧的柱子旁找到一些补药后，便离开了宫廷。出城来到郊区，我龙认为恩师为人光明磊落，是不会作出背叛帝国的事的，京怀疑是阴罗那个老巫婆背后使的把戏。前方就是亚弟希山了，哈普古德就隐居在那里。从北峰往前走过一屏可看到一名居民，从那里继续上山过一座木桥，再过两屏来到雪山地带，在一座房间门口遇到了一只背生双翼的玛雅人，他居然张口道出了京和我龙的名字，原来他是哈普古德的养子席加度，早已知道两人的来历了。我龙一人进屋后，京在外面担心父亲的安全，打败了席加度后父亲我龙走了出来，把京和席加度一起叫到了屋内，说明自已决定随哈普古德投靠第三帝国的事，于是派京和席加度先行下山，在临行前京与席加度还结为兄弟。
出了亚弟希山两人也走累了，于是决定在两大帝国的分界线古修森林休息一下，再越过森林的中心堡垒就可以进入第三帝国的领域了。两人来到中心堡垒遇到第三帝国的将军伊扎古，打败他后京道出了来意，让他领路去见法利鲁国王。那伊扎古是个妒贤忌能的人，思忖第三帝国现由大将军奎扎当政，必会欣然接受京等人的投靠，论才干他们均在自已之上，何况还有军略大师哈普古德撑腰，以后恐怕饭碗不保了，于是他决定派两人前去打僵尸岛，自已却在僵尸岛的附近布下伏兵，一见京和席加度出来就格杀勿论。此时的阴罗正率军去围攻亚弟希山，得知了京和席加度的行踪，如今我龙和哈普古德还在山上好象是在等什么人，她心中大喜，正好利用这个机会上山去收拾掉这两颗眼中钉。
第二章：僵尸岛
京和席加度在南边山上找到一个传送点终于到达了僵尸岛，京决定凭两人之力去对付那些僵尸。往山下去果真遇到了大批的僵尸，这时京已有些后悔了，不过想跑已来不及了，身后的大队僵尸纷纷围攻上来，真是一场恶梦啊！打退了三只僵尸后见那些僵尸还会复活过来，它们的口中好象还叨唠着“擅闯禁地”之类的话，或许是在保护着什么东西吧，于是席加度拚力挡住僵尸，京则入洞去探看，说不定能找到消灭僵尸的方法。
京进入洞中后看到一道耀眼的光芒，到前方走上一个传送点来到另一处黑暗的洞穴。京一路向洞穴深处走去，不时在墙上不断地给席加度留下记号，希望他能循迹赶上来。打开一道石门后，满眼都是高科迹文明的遗迹，走到尽头已没有路了。在一个箱子上有一道封印，京一时好奇心起上前打开了它，不想从里面飞出一只魔怪来，这时席加度飞进来说外面的僵尸也作鸟兽散了，可能是这个魔怪起的震慑作用吧。打败了这只魔怪索亚兰特后，它认定京是主人并愿意效力，外人只道岛上僵尸横行，却不知这里会有如此惊人的秘密。京看此地事情已了，便决定赶回古修森林去找伊扎古将军会合。
离开了僵尸岛在古修森林遇到士兵的拦截，连续三场战斗打败了伊扎古后，见敌人大军突然发生了骚乱，反帝军的比希斯出现在远处。京知道反帝军是一群追求自由和理想的热血青年组成的，专门与兵阀贵族作对，他曾经与他们交过手，对反帝军的首领汉斯鲁登很是敬佩。赶跑了帝国军后，京上前与比希斯谈话，得知父亲我龙被阴罗包围在山顶上，京于是随比希斯的部队冲往亚弟希山，在路过中心堡垒时可找到一名旅行商人补充一下装备。
来到山顶后，见哈普古德、我龙和汉斯鲁登已被阴罗大军重重包围了，两人上前将阴罗嘲笑戏弄了一番，一场大战随即展开。打败了敌军后，众人到屋中叙事，从反帝军比希斯的口中得知第三帝国已发生了叛乱，大将军奎扎拥兵自重早已废了君王取而代之，汉斯鲁登劝说众人加入反帝军的行列，众人觉得也只有这一条路可走了。
第四帝国的法哈帝知道阴罗已死的消息后大为震怒，同时他也知道大将军奎扎放逐法利鲁国王的事，认为这是进攻的大好时机，当即传令三军待命随时行动，待统一岛内后再报阴罗之仇。而那边奎扎将军听信了伊扎古的花言巧语，思忖如果法哈帝大军压境，自已王位估计是难保了，因为刚刚肃清法利鲁王的余党，兵士疲惫难以应战，便考虑到希摩罗多岛上去走一趟，请好友提波卡助一臂之力。
第三章：源石
按下多罗多岛上的事不表，再说希摩罗多大陆的大军师罗可可有个孙女，名叫安娅，今天是她的十八岁的生日，小丫头在房间里正猜测爷爷的礼物，这时希瓦走了进来并送给她一件生日礼物，原来是格斗大赛冠军的奖品。来到大厅门口往右来到爷爷的书房里，见零乱的书藉扔了一地，却唯不见爷爷的身影，到大厅问茜茜，得知爷爷已进宫去了，可见宫中发生了大事。出了大军师府往左下穿过王城来到皇宫内，女王正在和罗可可商量寻找动力源石的事，不过提波卡一直对女王的王位虎视耽耽，罗可可不敢稍离半步，安娅见状上前请缨前去寻找动力源石，女王当即应允。
此时提波卡和奎扎已经勾结在一起，订下了互助盟约，一方面提波卡帮助奎扎去打第四帝国的大军，另一方面奎扎也将派兵扶助提波卡从姐姐的手中夺得王位。
安娅和爷爷回到家中，罗可可说在特洛依大陆的各浮游岛都是神民运用惊人的科技制造出来的，每一座岛中都有一个动力炉支持岛的浮游，而动力源石就是主要的能源。在二百年前族人发现了这个秘密并把源石应用于战争之中，这样一来加速了能源的枯竭，目前得知有个圆石方舟就在第四帝国附近还末被人发现，可以去多罗多岛上看看，并把一封书信交给了她，希望能找到哈普古德的学生我龙，或许能得到他的帮助。
出了家门后一直往右下角走，穿过城市的中心广场，当走到一间道具屋时往右上边拐过去，这样可以到另外一屏，再往右上角走就来到了希摩罗多的城郊。向右边走会遇到前来搬兵的伊扎古，他见安娅秀色可餐，便不怀好意地搭起话来，安娅知他不是好货色出手就打，不过却被伊扎古击败，还好她福至心灵，逃出了伊扎古的魔掌，不知不觉进入到弦月山，看已没有退路可走也只有继续前行了。
这时前方忽然传来一阵打斗声，原来是叮叮铛铛这两个小女孩被一只异形甲虫攻击，安娅上前救下她们。谁知她们居然以长辈自居，称安娅的爷爷罗可可为晚辈，原来她们就是希摩罗多建国时最强的两名魔导士，一个擅长黑暗魔法，操纵风云雷电；另一个与异灵怪兽为伍，有深不可测的召唤术。不过她们不满足自已的修行，日夜参研当年神民遗留下来的魔法卷轴，在练婴儿飞天术时由于急功近利，百年的修行毁于一旦，现在连只小怪兽都对付不了。安娅这时向她们打听圆石方舟的下落，叮叮铛铛却想不起来了，两人决定随安娅同去以为臂助，安娅听了大喜，说出了这座山就可以到达魔法码头了。
