第四层 运转层 （Deck 4 - Operation）
任务：找到三台仿真计算机，并重新设定程序。控制芯片在三个红衣刺客（Cyborg Assassin）身上，抓住刺客得到芯片，重新控制与之对应的计算机。Weapons Lockup Code is 13433。
大厅中央是 Xerxes， 四周有一些舱门。41号舱门通向 Polito 的办公室，她垂头坐在椅子上，是自杀！她没能等到救援的那一刻，在毫无希望中孤独地死去，凄凄惨惨切切，是我来晚了（心里话：这其实不能怪我，得找编剧，都他一手策划的，我来早来晚她都得死）。此后撒旦（SHODAN）将从幕后跳出来直接指挥你，你可以坐下来抓住这难得的机会看一会儿资料片，听领导给你讲解些内幕消息。
第42号舱，这里有一个红衣刺客在入口不远处一晃就不见了，不打紧，在仓库里你会逮住他的。其身手敏捷，行动迅速，小心他的飞镖。夸张，是谁雇来了日本忍者！提防会发火球的猴子和异形掷弹手。记住你所找到的第一台计算机的位置（办公区：Office section），因为你找到的芯片不能控制这台机器。 第44号舱，在船员住处附近抓住红衣刺客，得到第二块控制芯片，用于控制42号舱内那台计算机。
第43号舱，寝区（Sleeping Quarters）附近的一间密室里你会发现一件完美的武器—assault rifle，经过你一番摆弄，一次可装填72发子弹，别说你找不到。在充电站附近抓获第三个红衣刺客。附近的某个房间你暂时进不去，需要等到你在第六层得到 OPS 令牌以后。
