第二十二回 新的敌人
足利义昭亲自来到毛利，要求毛利进攻织田。辉元还是不打算与织田战斗……但这时士兵报告说，本愿寺的使者来了。辉元惊讶地发现，所谓“使者”，仅仅是一个普通农民。那农民说，本愿寺的一向军全由贫苦百姓组成，织田军包围了本愿寺，寺里现在已经粮食断绝，老百姓正成批大量地饿死，现在请求毛利救援。知道老百姓竟受织田军如此这般残害，辉元决定不能袖手旁观，要送兵粮去本愿寺。安国寺惠琼大师提议用船队运输……此战惠琼以元就级别加入我军。
第二十二战 木津口之战
胜利：兵粮运输船队到达本愿寺领地内。
失败：一、毛利辉元撤退；二、运输队被全歼；三、毛利主营被占领；四、回合数超过60。这一战运输船是不受你控制的。你要分兵两路：一路派乃美宗胜、正木健一郎、村上吉充三个海盗头走水路护航；另一路由毛利辉元打头阵对付旱路敌军。在第十一回合，敌方九鬼嘉隆的水军从左下角出现。要注意防范他们偷袭我军大本营。如果小早川隆景、志道广忠是技术力在100点以上的军师，则可施放“大增援”法术，使全地图我军所有伤员的“血（耐久力）”补满。运输船的路线是：先沿海岸线行驶，然后要从右侧海滩登陆。再从右上角的桥过去……。在第二十三回合，右下角出现敌方佐久间信盛的骑兵。只要有一支运输队到达，任务即算完成。
第二十三回 鹿之介之死
织田军终于向毛利开战，毛利领地上月城被丰臣秀吉攻陷了。丰臣秀吉让尼子残党进城，山中鹿之介在城中四处布防。在高山城，小早川隆景向辉元提议，细田信长的三木城有个叫别所长治的武将，早就对信长残暴行为不满，可以劝降。出现选项时，可选“劝降别所”。由于隆景的计谋，织田的三木城城主别所长治揭起反旗。丰臣秀吉为了平息叛乱，杀奔三木城，上月城就只剩下尼子残部据守，于是辉元乘机进军上月城。
第二十三战 上月城之战
胜利：击退尼子胜久
失败：一、毛利辉元撤退；二、毛利主营被占领；三、回合数超过80。
战役开始后，在右上角有敌方骑兵不时出现，因此，需留一部分人马在主营。以备其“抄后路”。在第二十二回合，丰臣秀吉命令部队撤退，全力进攻别所，右上角的敌骑兵终于“消失”。战斗结束后，尼子胜久自杀山中鹿之介被活捉。辉元见山中鹿之介肌肉发达，是个搞体育的人才，要山中鹿之介臣服于毛利，山中鹿之介满口答应。辉元让山中鹿之介驻守周防，鹿之介欣然上路……。口羽通良等人早已看破山中鹿之介是假投降，实为图谋东山再起。于是口羽通良私下派世鬼政清去把山中鹿之介暗杀了……。
第二十四回 湖上之忠义
丰臣秀吉在上月城失败后，又采用了更巧妙的作战方式，他首先把宇喜多直家拉入织田家，然后诛灭了发动谋反的有冈城主荒木村重、三木城主别所长治。
到了后来，石山本愿寺也与信长讲和，退往纪州。信长的势力不断扩大，毛利被逼入守势。秀吉马不停蹄地开始进攻但马、因幡、伯耆，包围了毛利支城鸟取城。对此，毛利将吉川庶家经安的嫡子经家派到鸟取城。经家入城的同时准备守城。
由于秀吉围而不攻的包围战术，使鸟取城征集不到兵粮，时间一天天的浪费了。距山中鹿之介之死已过八年。秀吉的计划一步一步地走向成功，最后鸟取城的兵粮果然用尽……。在吉田郡山城，福原报告说，吉川经家自尽，鸟取城开城投降了……。丰臣秀吉的下一个目标是高松城，辉元派清水宗治去高松城，清水宗治表示与城共存亡。为了避免吉川经家的鸟取城悲剧重演，辉元准备亲自出征，救援高松城。
包围了高松城的丰臣吉秀军，首先以给清水宗治备中一国为条件，劝说清水宗治投降，但随即遭到拒绝。于是秀吉马上改变了策略，开始执行黑田官兵卫提出的计策，拦住守川，建筑长堤，让守川河的水向高松城流去。这样，高松城就变城了一个湖中孤岛，后来就连城里也被水淹了……。
考虑到要摧毁秀吉重兵把守的长堤难度太大，加上织田的大军正在向备中推进。辉元决定与秀吉讲和。
和谈代表安国寺惠琼回来说，秀吉的和谈条件包括：毛利割让出备中、美作、伯耋、备后、出云。除了割地之外，还要清水宗治切腹。
清水宗治听到消息后，主动乘一叶小舟在“人工湖”上切腹自杀。辉元也就同意了割地讲和条件，正在这时，探马飞报丰臣秀吉突然撤军了，大家都感到很奇怪。这时萤进来报告说，织田信长在本能寺被明智光秀杀死了！
辉元听到“本能寺之变”的消息，认为是一个绝好的机会来了（只可惜清水宗治白送了一条命），于是决定追击撤退中的丰臣秀吉。第二十四战 秀吉军追击战。
胜利；击退丰臣秀吉。失败：一、毛利辉元撤退；二、毛利主营被占领；三、回合数超过80。在第十四回合，丰臣秀吉逃进了姬路城。在第二十回合，辉元冲破重重封锁线直杀进姬路城。杀死丰臣秀吉即可过关。
