作为佛祖最优秀的弟子，最有希望继承佛祖之衣钵的人——金禅子却在苦思着神之哲学的对错，他发现了其中的荒谬与矛盾，也不认可神企图控制天地生灵命运，以便独享灵蕴的行为。他认为 “经”存在致命的算法缺陷，最终会失控而崩溃。为了教生灵们能突破神的控制，掌握自己的命运，他将自己的思索写成一部笔记。
几乎与此同时，一个在神的计划外的意识从天地中自然化生。它的外形是一只猿猴，却具有人的情感智慧与超常的灵性。石猴从佛祖的弟子——神仙的异类——须菩提那里学到了超脱天劫（神的控制）的本领，并对神制订的规则发起了反抗。
这次反抗最后发展到整个妖族与众神的战争，史称第二次天地神劫，反抗的力量之强大，差一点颠覆了整个东方。战争持续了漫长的时间，成千上万的神与妖相继战死。
在孙悟空大闹天宫、神妖战争的最关键时刻，金禅子和佛祖打赌：是有人可以超脱神的手掌的。但孙悟空却失败被压五行山下，金禅子也自毁了佛体和道行，转生成为一个凡人，失去了之前的所有力量与记忆，他曾经的著作也被禁毁，不知所踪。
五百年后，人类文明达到一个空前的高度，同时人类深陷于欲望爱恨之中。目睹太多欢苦与兴亡，人类渴望对世界本源和真相的进一步理解，在希冀理解人生的意义所在。于是，一位僧人挺身而出，开始了一场伟大的求索真理的远行。
这位叫玄奘的僧人并不知道，自己是金蝉子意志的化身。这位最有希望继承佛祖衣钵和西天神界统治权的人却因为质疑神对人类命运的控制和愚化，情愿毁去了自己的神识与灵蕴，转投到人间诞生为一个普通人，以表示自己和世间最苦难者站在一起的决心。地狱未空，绝不成佛，是他的信念。
神并不喜欢玄奘，因为如果一旦让他悟得世界的真理，人就能控制自己的命运，灵蕴将不再是众神的独享，与神的界限将消失。于是神布下了一盘棋，他们将几个记忆被封锁着的恶魔交给玄奘，并要求他们一路上杀死所有其他仍在反抗神的妖魔，包括几个强大的魔王，以赎完自己的“罪孽”。但在西游的路上，他们的记忆也在渐渐觉醒，陷入矛盾之中。
第一次西行的结果以神的胜利而告终，西行的四人，无论勇猛或是懒惰、谨小慎微或是兢兢业业，无一例外，最后都在路途中消灭了那些反抗的妖魔，同时也消灭了自己，当然，神们把这一过程叫做磐涅。但是，自由的意识永不消亡！英雄的后人们，即将再次上路，去发现那已被掩盖了太久的真相。
第一次天地神劫之后，人类被放逐到九天之下的这块大陆上来，当时的大陆分为四块，飘落在大海的中央，神们认为跟他们居住的九天比起来，这里就是穷山恶水。当时的神，怎么也不会想到，若干年后，这里成为了他们与其它种族争夺资源的主要战场。
随着人类在大地上慢慢繁衍，这个种族坚忍不拔的耐性和强大的意志力逐渐体现出来。他们使山川平移，江河改道，这些穷山恶水逐渐变成了美丽的风景，他们给四块大陆取了气势磅礴的名字——东胜神州、南瞻部洲、西牛贺州、北俱芦洲。
虽然妖、灵也在这里生存繁衍，但是，由于人类种族数量的巨大，以及他们对改造世界所作出的不可估量的浩瀚工程，我们依然将这里视作人类的故乡。
