本游戲的主人公約那森·你，曾經是一個富於正義感的傳教士，由於對自己的信仰產生了動搖，便開始從事巫師獵人的工作。當你聽說了艾麗·凱沃的傳說後，便決定到布萊爾城去探詢宗教和神秘主義真理。
游戲一開始,你正在給馬裡蘭州巴爾的摩的朋友寫信。告訴他自己將在明天去布萊爾鎮調查那裡發生的事情。
當你走在去布萊爾鎮的路上時，遠處有一個老婦女正在匆匆忙忙離開城鎮，你便走上去和她交談。老婦女將布萊爾鎮發生的那些恐怖事件告訴了你，並警告你，災難已經降臨到了布萊爾鎮，你最好立刻離開。繼續往前走，看見昔日繁華的街上一個人也沒有，兩邊的房子都上了鎖。在到達教堂之前會遇到一個父親帶著他的孩子，和他交談，父親非常不情願地告訴你鎮上有許多孩子都失蹤了，大家都懷疑是布萊爾女巫做的。所以大家都紛紛逃離這裡，父親說如果要了解詳細的情況最好去鎮長官府找法官約那·思德，說完，兩父子就離開了城鎮。
現在去調查所有的店鋪、酒館及其他的民房，不是上了鎖就是沒有人在。到街道右側的糧倉，是一間有兩個白色門的房子，裡面會有一只狗跑出來要咬你，你可以用明火槍打死它，然後拿走一壺威士忌酒。離開糧倉進到教堂前右側的鎮長官府，從前門進入到右邊的法官辦公室，按照前面那位父親的建議，與裡面的地方法官約那談一談。他會將布萊爾鎮和附近發生的神秘事件都告訴你，特別是棺材石發生的事件。他堅持不要外界的乾涉，他還告訴你他已經關押了兩個嫌疑犯在監獄裡，就等著巴爾的摩來人審判。在你的堅持下，法官給了你監獄的鑰匙和棺材石的地圖，並允許你去和兩個囚犯交談。另外，約那還建議你到神父古德菲那裡找一些線索。等法官說完之後，從前門離開鎮長官府，然後到教堂。
進入教堂後面的白色小屋，與神父海爾·古德菲交談，他會按宗教上的觀點來分析最近布萊爾鎮發生的事件。神父還告訴你棺材石位於小鎮旁的森林中間，現在森林裡到處都是僵屍，他請求你為了全鎮的人們盡快查出事情的真相，將布萊爾鎮從災難中解脫出來。等神父說完之後，再進入監獄。
順著臺階往下走，到門口用法官給你的鑰匙開門。進去以後向右轉，沿著石階一直向前，然後到左邊的牢房和第一個囚犯酒鬼賀潤·黑濤交談，但他堅持說如果沒有威士忌酒，他一句也不會說。拿出你從糧倉裡拿來的威士忌給他，他聲稱自己是清白無辜的，他只是為了躲避可怕的女巫艾麗·凱沃。然後隔壁的牢房和由於被控施展巫術而被囚禁的伊麗莎白·泰樂交談，泰樂告訴你她是作為異教徒而被囚禁的，她也同樣聲稱自己是無罪的，她只是法官過於豐富的想象力的犧牲品。為了查出事情的真相，你決定去棺材石看看。
