为了终结这场战争，失去理智的联邦决定采用尚在试验阶段的最新科研成果：正反物质湮灭装置，这是基于反物质原理开发出来的一种设备，正反物质的互相湮灭可以释放出巨大的能量。之前，这种设施一直被用于高能物理的研究领域，小规模的湮灭一直在可控的范围内，联邦的政府高层都幻想着可以用这一手段一劳永逸的解决问题。
2089年3月5日，联邦决定对同盟秘密投放大规模正反物质湮灭装置，同盟的情报部门早就获悉这一行动，派出一个小型突击舰队和三个整编的机甲小队袭击联邦的行动小队，同盟的突击舰队成功的拦截了联邦的运输舰，击毁了联邦全部的护卫舰船，在运输舰内的联邦指挥官，霍特上校眼见行动失败，开启了湮灭装置，地狱之门被打开了。
正反物质湮灭的规模和反应的范围迅速扩大，很快就波及到了地球与火星，2颗星球的大气层被肆虐的能量流冲击的消失殆尽，人类到了毁灭的边缘。在这危机的关头，从被能量流冲击的已经偏离轨道的月球背面飞出了一艘碟形飞船，整艘飞船被蓝色的能量罩包围着，无惧那充满了外部空间的能量乱流，用超出人类认知的手段平息了这场灾难。
这一日被称为浩劫之日，也被称为新纪元的开始，被定为宇宙历元年1月1日。地球120多亿和火星近80亿的人口在这一天幸存下来的不到5%，星球的地表一片荒凉，生态环境几乎被完全摧毁，人类终于品尝到了自己一手造成的恶果。
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