对战模式详解
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| 角色选择画面：按△随机选择角色，一部分角色按住□可选择2状态，按start可选择2-4人对战人数 |
| 角色组队分配：同组为合作，1vs1 1vs2 1vs3 2vs2，忍术分配选择（通过剧情或暗号取得各种忍术，忍术只能分配一个对应自身属性的忍术，黄色为自身忍术），△为指定随机（组队，忍术，lv等级-角色能力值强度） |
| 对战设定：战斗时间，难易度（最高究级），道具出现频率（无-多），查克拉（可无限），奥义使用（可/不可），初期设定（默认） |
| 场景选择：△随机选择，本作一些场景变只有近景无法换线，一些场景增加为近-中-远景3层。 |
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对战示意图
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| 1 | 玩家显示：显示所操作的角色，同颜色代表一组。 |
| 2 | 限制时间：显示战斗结束为止限制时间，可选无限，时间结束按体力多者或组队战以剩下人数多者获胜，如不分胜负则平手。 |
| 3 | 体力槽：显示角色的体力量。 |
| 4 | 查克拉槽：显示角色的查克拉量。 |
| 5 | 觉醒计量表：显示角色觉醒解放状态，满了后，按l键解放，觉醒后查克拉补满，有时间限制。 |
| 6 | 状态变化：显示该角色目前状态变化。 |
| 7 | 使用道具：显示可以使用的道具，本作只限使用一道具，同样道具也只还是只能拿一个，可以不被场地换线限制而使用，道具已不会对自己受伤害。 |
| 8 | 特有道具：显示角色的专属道具，消耗查克拉。 |
| 9 | 连携信号：显示该角色与同组角色能使用连携忍术，有一定距离限制，且要有能发动自身忍术的查克拉量，颜色与同组角色代表色相同。 |
| 10 | 封印的觉醒计量表：显示角色觉醒封印状态，能通过攻击或被攻击逐渐解放。 |
对战操作详解
| 蓝色为系列新增系统 | |
| 攻击 | 按o键，不同方向+连续按键的组合形成连击，角色觉醒后会发生变化，部分角色可长按o键强力攻击。 |
| 防御 | 按r键 |
| 道具使用 | 按□键（本作只能拿一个道具） |
| 跳跃 | 按x键 |
| 2段跳跃 | 跳跃中再按x键 |
| 高速移动 | 按2回x键 |
| 步进 | 方向→→或←← |
| 受身 | 被吹飞时空中按x键恢复体势或着地前按x键恢复体势，减少伤害 |
| 轴移动 | 场景中方向↑+x或↓+x |
| 无法防御 | ↓+o键的下段攻击 |
| 破坏防御 | 持续受普通攻击10下左右，防御特效由绿色变成红色从而破防 |
| 防守反击 | 对方攻击的瞬间按r键再o键，将对手击飞 |
| 替身术 | 受攻击的瞬间按r键 |
| 查克拉蓄力 | 按住△键不放 |
| 特殊道具 | 按△键后再按□键，消费查克拉 |
| 蓄力冲刺 | 按△键后再按x键，消费查克拉(可蓄力） |
| 忍术 | 按△键后再按o键，消费查克拉 |
| 连携忍术 | 特定角色靠近一定距离时（看对战图示），按△键后再按o键，消费查克拉 |
| 奥义 | 按2次△键，再按o键，消费查克拉（角色觉醒后无法使用）奥义画面中，在限制时间内，通过按键提示依次输入，输入指令错误一次则中断输入，但不会中断奥义，攻防百分率决定最后的伤害（本作奥义画面终于可按start跳过）多人组队对战时，携友的奥义画面由（ox△□确定）奥义%率攻击加成 |
| 觉醒 | 觉醒计量表满后，按l键解放，过了限制时间后恢复。 |
| 壁走术 | 沿着墙壁等物体吸附着垂直往上走 |
| 水上步行术 | 行走在水面上，会消耗查克拉，无查克拉时会掉落水中 |
联系模式详解
| 进入对战画面后按start选项 | |
| 操作设定 | 基本按键的替换 |
| 1p操作指令表 | 角色的出招表 |
| 基本操作 | 基本的指令表（参考上面的战斗基本操作详解） |
| 输入指令显示 | 开/关，画面下方显示自己的输入键位 |
| 练习设定 | |
| 主设定 | 战斗时间，难易度（最高究级），查克拉（通常/无限），觉醒计量表（通常/无限），道具出现频率（无-少-普通-多），显示招式名（关/开），初期设定（默认） |
| com设定 | 状态（com，站立，跳跃）。攻击（不动，一拳拳攻击，随机攻击，飞行道具，奥义）。防御（防/不防） |
| 行动 | 不跟随着你/总是跟随着你 |
| 变身 | 受攻击使用替身 |
| 初期设定（默认） | 设定复位 |
| 标题画面 | 退回主标题选单画面 |
| 选人画面 | 退回到选择角色界面 |
