prophet的意识已经完全保存在了纳米服里了，到游戏最后就会发现。
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主角是名叫“alcatraz”的海军陆战队队员，运输途中遭遇外星人袭击，处于死亡边缘，被prophet所救。由于prophet感染了外星病毒，成了类似于活死人/walking dead（意识存在，肉体已经不行了这种。和丧尸之流正好相反）的东西，脱离nanosuit后，会被慢慢侵蚀。（游戏中期会发现alcatraz也被感染了，所有脏器全被感染破坏，仅仅靠nanosuit存活）
prophet将nanosuit给了alcatraz，寄希望于alcatraz，然后举枪自尽。敌人和联络他的科学家到中期才知道nanosuit中的人已经不是prophet，换人了。
整个游戏里纳米服公司的雇佣兵为了夺取这套服装要追杀主角。一代里面派遣纳米服特种小队去执行任务其实是纳米服公司大boss prism的阴谋，为了进入核心，获取外星人数据，打造超级人类特种兵，对抗外星人（也有prism的野心），而期间的媒介就是prophet的这套纳米服，融合了外星生物的数据。最后就是prophet的这套纳米服逆向摧毁外星生物。
结局处，由于prophet的意识保存在了nanosuit里面，告诉alcatraz“我们（指prophet和alcatraz）还不能死，这还远没有结束”。
结局过后一段动画出现有人联络主角
“and you are？”
“they call me ……… prophet”
应该是那套nanosuit里面包含了prophet和alcatraz 2个意识，抑或是2者融合。
话说crytek也开始玩花样了。
