故事系统是《九天神话》创新的特色系统之一，类似于主线任务，却又不同于主线任务。
每个故事有着连续且相互独立的情节，各个故事将以书本的形式展现出来。每个故事是有进度推进的，需要通过完成故事当前进度的目标来推进故事到下一个进度，故事的进度亦受时间控制，无法将故事推进到未开放的进度。同一时刻内一个角色身上仅能激活一个故事，并可查看角色已完成的故事进度，故事会引导角色进入副本或与城市里的NPC对话等，完成特定故事进度会获得不错的奖励哦。
在中国文化的历史长河中，中国神话曾经有过一段时间的蓬勃发展时期，那时候的中国神话里面，神仙和凡人一起生活在这个世界之中哦，在这里，人、妖、神、怪、仙都居住在一起，他们习惯对方的存在，互相熟悉，互相了解，互相争执，也互相友爱。人们也利用从神仙那里学来的方术，抵御妖魔鬼怪，守护着自己的家园。
这是一个崇拜方术的世界，方术被大家普遍的使用，用在了生活中的方方面面。所谓方术，其实是由仙人们传授给人们，用来在恶劣的生存环境中生活的能力。掌握了方术的人被称为术师，他们越来越被崇拜，越来越多的年轻人开始修行方术，方术在人间的使用达到了一个极盛时期。。。
