如果要说前作是一款精美的FLASH游戏画面，《植物大战僵尸2》确打破了前作的画面卡通局限，把动画也加入在游戏中，比如豌豆射手吐子弹的时候会把腮帮子鼓起来，还有僵尸的动态性相对前作来说都有改进。
玩家可以对任意植物进行施肥，施肥过后的植物会释放出威力强大的技能，如豌豆射手施肥后将化身机枪豌豆进行直线乱枪扫射、 坚果会为自己披上一层钢盔，甚至连向日葵也可以通过施肥来瞬间生产数个阳光。
肥料的获取需要击杀特点敌人，善用技能系统，无论是救场还是清场都有很好的效果。
手势必杀技系统，顾名思义，需要玩家利用手势（捏合、迅速滑动、点击拖曳）来施展，并且对敌拥有一击必杀效果。
这个设定显然是借鉴了那些强调手指操作的塔防游戏的灵感，是最强力的救场/清场技能。在埃及关卡中，还出现了一个有趣的设定——连连看关卡。
在这种关卡中，玩家要掀动僵尸身上的石板，两两匹配即可消除敌人。当然，一代中五花八门的关卡玩法也依然保留。
虽然《植物大战僵尸2》画面风格依旧是以简单的卡通风格为主，不过本作的画面渲染方面做的要比前作好许多，前作的简单线条显得游戏感觉比较类似于FLASH游戏，而本作看起来似乎还像点手机游戏的模样了。
