美军指挥官“霸王”（谢菲尔德将军的继任者）命令仅有的一支可以联系到的特种作战单位 ——三角洲部队的“合金-01”小队，配合地面部队摧毁电磁干扰塔。小组成员桑德曼，冰人，卡车以及格林奇四人经过一番苦战终于攻占了华尔街的纽约证券交易所，炸毁了位于屋顶的全频段电磁干扰信号塔，恢复东海岸的指挥通讯系统和制空权，使得美军成功将战线推回了哈德逊河岸。
话说普莱斯和尤里刺杀马卡洛夫，尤里挂了，但还是为肥皂报了仇。美、俄两国也重新建立了外交关系。几年后，新接任的美国总统是亨利·马歇尔，他心里有非常重的冷战思想，对上一次战争总耿耿于怀。他经过一年的宣传与谋划，终于把美国80%的民众煽动起来支持他进攻俄罗斯的计划。此时，他命令美军总司令杰弗逊将军出动三路大军同时袭击莫斯科、库尔曼斯克和海参崴，杰弗逊劝他冷静冷静，而马歇尔总统却私自谋划了一场“苦肉计”，让四个特工装扮成俄军特种兵，潜入白宫刺杀他自己（此时玩家需扮演特工艾伦完成这场刺杀行动）。当四人进入总统办公室时，马歇尔已经跑了。
