现代战争3是使命召唤：现代战争系列的收尾篇。在本作当中，由扎卡耶夫、马卡洛夫、谢菲尔德将军引发的全球战争将在各国首脑的斡旋下宣告结束，而被列入恐怖分子名单的马卡洛夫亦会在TF141和各国军事力量的协同行动下最终被绞杀。然而，现代战争系列的最终结局却也不能算一个完全的喜剧。从现代战争到现代战争3，登场人物到最后只有屈指可数的两三个人活了下来。在本作当中，玩家将先后扮演俄罗斯抵抗运动组织成员Yuri、三角洲特种部队成员Westbrook、FSO特工以及TF141的Captain Price，辗转于陷入战火的全球各大城市，从纽约、柏林到巴黎、伦敦，一方面在正面战场对抗俄军和极端分子军队，另一方面在隐秘战场直接追踪马卡洛夫，并最终将其消灭。
正当马卡洛夫准备干掉普莱斯时，尤里的出现吸引了马卡洛夫的注意，两人相互对射，最后马卡洛夫在被尤里击中的情况下射杀了身受重伤的尤里。而普莱斯在随后的搏斗中用钢丝绳[2]勒住了马卡洛夫，并把他从酒店天台的玻璃地板中摔了下去，把他活活勒死。随后普莱斯看着马卡洛夫的尸体，点起了标志性的雪茄，《使命召唤：现代战争3》至此全篇结束。
