剑3问情篇以发生在仙剑3故事之后的一个事件作为引子，将长达19年的一段恩怨情仇娓娓道来。第一男主角南宫煌的父亲赤炎乃是从锁妖塔中逃出来的狼妖，与蜀山女弟子丝缎一起隐居于山野，但终究没有逃过仇家的追杀。南宫煌被蜀山派门人常纪收养，视同己出，长大后更担负起了拯救蜀山危难的重责，同时也揭开了自己的身世之谜。游戏中当然少不了“仙剑系列”一贯擅长的感情戏，两位女主角各有特色，令人难以抉择，同时游戏中还增加了友情、亲情的成分，玩家将会接受一次情感浪潮的冲击。
纳林河源：
一层：存盘点北东下，北上至上层雷元戈开机关－北过桥，树丛西－东南－西过桥，下最南边的台阶－东南开机关，西南上阶，西北上阶，西下阶－北－西－北，西南开机关，东上阶得古代宫廷服饰图（用于制作广袖流仙裙）。东北下阶，西－西，西北开机关，南－东南上阶，北得雷宝箱（温慧开，得夜行靴、太极天冠等）。北返，北－东阶：北上到二层A区；东下阶则到二层B区（正确出口）。
二层A区得糯米、烟月神镜、雪莲精、天禄辟邪玉、赤环甲。雷系大宝箱（慧开）得绛纱复裙、金刚斗笠、鲤鱼等。尽头绕回到入口，出来东下阶至二层B区。二层B区：右上，沿冰梁至左边，东边下层雷元戈打开两个机关。返回上层，北边冰梁至右侧，上层东北开机关，前面向西开机关，再沿冰梁向西开机关，下层东上阶开机关，返回过冰墩北上，开北边的机关后，上冰梁从下层至三层。 ｛三层BOSS 土灵兽 土 界 HP8000｝
风卷尘生 打蛇女 得雪蛇筋； 惊雷闪 打花精 得幻香花蕊
偷：花精 石南藤*2；蛇女 银凤钗；矮人 解咒草；土灵兽 雪莲精*4
剧情后回到胜州，此时再返回纳林河源，过桥遇妙云〔毒龙胆支线〕。回胜州斜人柱乙完成此支线。祭坛剧情，得到《炎宿》。赠送合成界面开启，此后只要队中有伙伴，进客栈选择住宿后便可选择赠送并合成物品。
支线：
1、 （要求絮儿在队中）御剑回绿萝山向前进绿萝嶂，下索到坑中上对面索，向前遇到圣姑和青儿，剧情后点左边表情送给青儿食物（圣灵珠支线）。表情选择：左边表情絮儿好感+5，继续剧情。
2、 回唐家集，卖面的摊子前完成栗子面支线。 返回蜀山派。
