剑3问情篇以发生在仙剑3故事之后的一个事件作为引子，将长达19年的一段恩怨情仇娓娓道来。第一男主角南宫煌的父亲赤炎乃是从锁妖塔中逃出来的狼妖，与蜀山女弟子丝缎一起隐居于山野，但终究没有逃过仇家的追杀。南宫煌被蜀山派门人常纪收养，视同己出，长大后更担负起了拯救蜀山危难的重责，同时也揭开了自己的身世之谜。游戏中当然少不了“仙剑系列”一贯擅长的感情戏，两位女主角各有特色，令人难以抉择，同时游戏中还增加了友情、亲情的成分，玩家将会接受一次情感浪潮的冲击。
渝州：
剧情后学会洒金笺或倾国银弹波
支线：1、再进新安当，接下寻找景小楼的任务（镇妖剑支线）。
2、出来后门外左边与李三思对话接下寻找古董任务（梦溪杂录支线），选左边表情事后可得梦溪杂录203页（用于制作震天雷）和银杏子。
西边摊子上得纸张，民居戊得山楂。过桥到西南部。
支线：桥边与渔翁对话（乾坤一掷支线，需要软骨浆），调查竹篓后再对话，之后选择表情：选左边温慧可学会乾坤一掷，选右边不能学会，但是增加好感度10。
逍遥客栈桌上得苹果。过桥坐小筏到北部。民居甲得鸡蛋，豪华民居二楼得五方剑图谱（用于制作五雷正法）。仁和堂门前小箱得聚宝盆等；门右药箕下边得钱。永安当后面贴着山壁走，尽头小箱中得豹牙手环等。
支线：永安当后接到捉鬼任务。（完成可拿到金钱奖赏和驱灵大师称号）
城隍庙东鸡群旁遇到景小楼。
西边上坡至上层，吊脚楼甲得星叶草花种（用于制作血石戒指），吊脚楼丙得鸭嘴型柄漆盒，旁边得搜宝鼠。
*门外右边救世主讲解 太阳华池走法，它的南边小箱得锈铁钉等。
回北部，民居丁内剧情－对面城隍庙左边与李三思对话－民居丁剧情，之后回西南部。逍遥客栈屋后遇到景小楼。回东南部－新安当内往里走，与伙计对话后出来。回到北部，民居丁完成剧情，得到李三思赠的银杏子。
上层吊脚楼乙遇景小楼。回西南部，向西南走，竹林的空旷处遇到景小楼和儿鬼、白虎。选择左边表情触发战斗（可用散花天女解除儿鬼隐身，龙翔打白虎得白虎皮）。得到镇妖剑。西南部路旁有个红衣男子和一个褐衣大汉的路尽头到御剑飞行大地图。
支线：
1、胜州（招魂幡支线）－画角寒天－左下阶，在一块田间有农夫和耕牛的地北边，屋内调查花盆触发剧情。雷元戈学会招魂幡。
2、蜀山派后山醮坛完成桃子的梦溪杂录支线。选择表情，右边得杂录，左边增加好感10。
