剑3问情篇以发生在仙剑3故事之后的一个事件作为引子，将长达19年的一段恩怨情仇娓娓道来。第一男主角南宫煌的父亲赤炎乃是从锁妖塔中逃出来的狼妖，与蜀山女弟子丝缎一起隐居于山野，但终究没有逃过仇家的追杀。南宫煌被蜀山派门人常纪收养，视同己出，长大后更担负起了拯救蜀山危难的重责，同时也揭开了自己的身世之谜。游戏中当然少不了“仙剑系列”一贯擅长的感情戏，两位女主角各有特色，令人难以抉择，同时游戏中还增加了友情、亲情的成分，玩家将会接受一次情感浪潮的冲击。
月光城：
一层：在离宫和陆北亭北边得到首阳参。西雪莲精－南－十字路口东北烛龙内丹、800文钱；向南走到底，西得还魂香、美食方99页（用于制作糯米糕）。西－南－西：北过蘑菇－西－北神炼水、引路蜂、2500文钱；东－北（火药、烟月神镜）－东，东边和南边各有一个紫色的蘑菇状机关，开东北的机关连接通道，向西南方沿连接的通道至二层。
二层：存盘点北紫菁玉蓉膏；（西至木桩前，如果做石斛花种支线，此处可拾到慕容雪的遗书和玉露丹。）西南木桩得九转再造丹等；尽头南宫煌开尖刺状机关，西北小箱得七星侗笛；东上－西小箱（蚕丝、彩色染料、800文钱）；东－北上－岔路：西南小箱得凤纹披风；西北机关；东南北上－岔路：东南机关；西－东南小箱（无影神针、钱）；南－西－北上，西南小箱（软骨浆、粗麻绳、纸张）－西开出口的机关。此时东返，南下过翼状通道回||状路口处，东南－东南过翼状通道，笔直西进，北得雷宝箱（温慧开，得雪虹鞋、神火飞枪、定风草等）。原路回北侧出口至三层。
三层：｛BOSS风灵兽会眠、封、定。可用醉梦引 人形：HP 10000；兽形：壁状态HP 13000 }
偷：幽灵甲得软藤甲；鬼轿子得驱魔香；地缚棺得驱魔香；风灵兽人形紫菁玉蓉膏*3；兽形封神结*1。
得到风灵珠。再进月光城完成剧情，回到施洞。
支线：民居戊旁与蓝衣男子对话，得到200文钱。民居丙旁见到老妇和小孩，进去后表情选择：选择红心将不增加好感。出来与男子对话继续任务。
