仙剑3的剧情发生在初代的五十年前。渝州最大当铺──永安当的伙计景天每日幻想能富甲天下或成为蜀山剑仙，认识了当铺主人唐家堡的大小姐雪见。同雪见、雪见的宠物五毒兽花楹展开冒险。在结识蜀山派弃徒徐长卿及其恋人紫萱后，开始为协助蜀山找寻失散各地的五颗灵珠。
五大结局存档：
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雪见结局：
达成条件：铸剑厅时雪见好感最高，最后的决战输给重楼。
紫萱结局：
达成条件：紫萱好感最高，锁妖塔决战后游戏结束。
龙葵结局：
达成条件：铸剑厅时龙葵好感最高，最后的决战输给重楼。
花楹结局：
达成条件：花楹好感最高，但是在铸剑厅时龙葵好感要高于雪见，锁妖塔决战后游戏结束。
完美结局：
通过11、13存档都可以达成，最后的决战必须打败重楼。
