《太古封魔》副本系统精彩无限，这里有精致唯美的副本地图，由弱及强的阶梯式挑战难度，高AI强策略的BOSS设定，还有大型副本争夺战，精彩多多，乐趣多多。
《太古封魔》中，每个副本都有三个BOSS，N只小怪，拥有足够的挑战性。精心设计的副本路线让你可以有选择的绕开部分不想击杀的怪物，直接寻找你要剿灭的副本怪物和BOSS，
《太古封魔》的副本地图一共有三类，普通副本、精英副本、英雄副本，分别满足不同需要。
普通副本：单人副本，按等级陆续开放。
精英副本：2～3人副本，按等级陆续开放。
英雄副本：3～5人副本，100级以后开放。
每个类别都有数个不同副本可供选择，以普通副本为例，普通副本一共有九个副本，等级跨度从15级到95级。而精英副本、英雄副本则只有八个副本。
《太古封魔》副本系统拥有十分便捷的导航系统，可自动寻路抵达，也可传送抵达，副本还特设“扫荡”与“重置”系统。
副本扫荡，简而言之就是由系统自动扫荡副本，每次扫荡收益低于手动扫荡，且每次扫荡会消耗一定的晶石和时间。
副本扫荡适用于已经被通关的副本，意即，要先行清光某副本的所有大BOSS小怪物，完成“通关”，点亮“通关”标识，方可进行副本扫荡。
并且，在扫荡之时，要保证包裹中有足够的空间存储副本掉落奖励。
副本重置是对副本进行重新设置，适用于半途退出副本后的状态，是对副本状态的更新。
玩家在通关副本过程中，如果从战斗撤退或是因为其它原因非正常通关而半途退出副本后，再次进入该副本，会从前次退出时的状态继续，举例而言，如果某副本除BOSS外所有怪物被击杀，此时退出副本，再进入时，副本中依旧只有未被击杀的BOSS，其它已被击杀的怪物并未更新。
每次通关副本，都会得到各种勋章奖励，普通副本获得副通勋章，精英副本获得精英勋章，以此类推，累积勋章可到副本的勋章商城兑换奖励。
副本更有副本争夺战的玩法，当各大仙盟成立，将对副本进行资源争夺，占领副本的仙盟可以持续拥有副本，享受副本每日持续给予的收益。
