航海世纪中的技能分为四个类别：战斗系、贸易系、采集系以及生产系。 学习技能和特技可以去城市里找到技能导师，满足条件学习后花费一定银币就可以学习。人物所有技能等级总数可以达到1700级。
航海技能等级高低影响航行时所能使用的特技以及可使用的船只种类，在公海航行可增加航海经验以提升航海等级。
进行物品合成需要先学会合成技能，装备好相应的工具，要合成某个物品必须先学会该物品的设计图。普通的设计图可以在NPC那里购买，高级设计图则需要通过其它途径获得。等级越高能合成物品的种类越多，成功几率也越高
