太古之时，共工氏怒触不周山，四极废，九州裂，混沌魔气灌入凡界。
虽有女娲炼五行石补天，却始终晚了一步。
混沌魔气在玄冥之地九黎野聚集，孕育魔胎，诞生出绝世魔君蚩尤。此时伏羲诸位大神早已飞升天界，女娲亦不在，世间无可阻止为杀戮而生的蚩尤。
黄帝率众迎战，却是不敌，后有九天玄女点化，黄帝与炎帝联合，采集首山神铜，于炎帝洞的熔岩池铸炼神器轩辕剑。
铭刻山川草木，铸印日月星辰，蕴养浩然正气，轩辕剑肩负天下苍生所期望，竟在剑成时自生剑灵，于涿鹿神魔之战时将蚩尤斩杀。
只是，在蚩尤被斩之时，剑灵因所成之日尚少，不敌魔血侵蚀剑身，沉睡消逝，轩辕剑成了一段凡铁，并且从此不知所踪。
蚩尤被斩杀后，为防其重生，黄帝将蚩尤的魔身分为四块，分葬四地，并由四仙器天雷枪、圆月轮、蜀山剑、云华杖镇压封印。
漫长岁月悠悠，浩瀚九州，众神绝迹，一仙难觅，凡人逢天灾人祸，经生老病死，难免对死亡产生一种惧怕的阴影，随之而生的便是对长生成仙的渴望和追求。
因为四仙器的缘故，四大封印之地所立起的守护门派天雷门、圆月庄、蜀山派、云华境便成了凡间的修仙正统。
正当凡人潜心修仙求大道之时，由于天外混沌魔气无时无刻的侵蚀，昔年女娲炼石所补天缺之处竟出现裂隙，而蚩尤的封印隐隐有松动迹象。
魔气无时无刻的侵蚀，心志不坚者难免坠入魔道，妖族化为魔，修仙者沦为魔修，更有凡人衍生戾气，勾心斗角，引发兵祸，自相残杀，九州陷入乱劫之中。
四仙器守护门派渐渐的明白，若想克制魔气封印蚩尤，还须上古神器轩辕剑。只是如今轩辕剑不知所踪，并且封印之地的魔气日益侵蚀，修为低者难以抵御，各门派束手无策，只好通过上古传送阵将弟子们送下山，去寻找九天玄女传人芷云，以获得轩辕剑的线索。
而我们的故事，便是从凌云渡开始……
