跨越千年副本从商周时代开始就会出现了，每一个副本都有自己独立的场景，副本中可分为3个职业进入，督军，神策，先锋，每一个职业在副本中都会有自己独特的技能，以及移动范围攻击范围的大小都是各不相同的，副本最多可以4个玩家加入，难度分为3等，个人试炼，组队闯关，组队挑战，从左向右依次类推难度会越来越高，同时根据难度不同装备掉落也不同，难度越高掉落的装备品质也就越好。
副本是采用的手控战场，需要4个玩家相互配合，玩家可以利用每个职业不同的特点，来相互支援围杀敌人，同时场景里面还会有很多点可以利用，也就是所谓的地形优势，来绕、躲、跑、围来击杀敌人。
副本的难度越高需要玩家之间的配合也就越默契，如果一个玩家马虎很有被灭团的危险，在副本中每支队伍会有很充足的行动时间，4个人好合理协商战术站位走位，给予每只敌人部队最大化的输出，和承受最小的伤害。
