学园编
非常简单的剧情。限制回合为25回合。目的主要是为了让玩家熟悉基本操作，所以不能实施内政相关指令，只要集中精力战斗就可以了。而且，在这个剧情中加入的伙伴可能是直到最后都会跟着你的人。但是，因为大多数场合都有“让OO加入则XX就不会加入”的限制，所以一定要慎重选择。伙伴组合参考下表。
宮里絵梨花·ショーコ·サキ ? 中西剣道·中西弓道 備考：宮里絵梨花加入的话可以收コメートさん，中西剣道加入的话可以收叢雲静梨。
フランシーヌ山吹 ? 伊集院玉利 備考：不管是那个，要达成五星都非常不容易。
堂本瑞貴 ? 根岸ななな 備考：根岸ななな加入的话可以收アバオ亜空。
山本無頼 ? 月読きなこ 備考：---
另外，虽然在这个剧情中还不能加入，但在3F实行「図書室（本を借りる）」，而且始终不执行本を返却的话则針山紙魚子会在全国编中加入。不还书或根本不借书，则白百合小百合会在全国编中加入。虽然这也是两选一，但基本上都不是可靠战力，所以随便选那个都不要紧。顺便说一下針山紙魚子是没有五星事件的。
还有，在这个剧情中实行「仲間を捜す」加入的汎用伙伴比県内編以后加入的汎用伙伴信赖度要高一个等级，而且可以通过面谈提升一个信赖度等级到“绊”。
完成本剧情，需要在運動棟打倒山本無頼得到IDカード，同时知道地方大本营的情报，接下来占领執行部室，实行「決戦闇崎アキト」指令，在死亡决斗中取胜即可。
·県内編
在这里剧情会根据玩家的行动有极大的分歧点，十分重要。限制回合25会合。从本剧情开始加入了内政要素，所以也有必要注意非战斗地域的配置。敌方有獄煉和戦争寺两个势力，最后打倒獄煉则通向久那妓路线，打倒戦争寺则通向扇奈路线。
第1回合BP为0，但从第2回合开始斬真豪会定期拿来BP（不过以后是要还的），所以不会陷入BP不足的状况。虽然支配地域也有微量的收入，但不要指望那个了吧！如果有空闲就到闘京的サンシャインⅥ最下層去练级，第二回合以后去的话可以拿到一次200BP。另外，在サンシャインⅥ第5層会发生凱場マック的事件，看过这个事件以后下次让他加入时就可以省去些麻烦。
中王区的たんたん３号店里可以购入道具。种类有「伝説のコロッケパン」「不思議犬」「シルバーリング」「便所掃除セット」「ぽわわ銃」「ソノシート」等，钱多余下来就去买吧。
从这个剧情开始可以对敌实施「捕獲」，当敌方体力下降到10以下就可以捕获了，体力为1时100%可以捕获（除了战斗中敌方状态框为灰色、显示“捕获不可”的角色是不能捕获的）。这里为了能捕获俘虏，需要利用攻击力较低的伙伴以及日比生咲苗的手加减技能「やさしい攻撃」。
还有，跟学园编一样，不少角色都只能两选一，详细参考角色资料集。
最后，占领江怒川区后韋駄川煉就会急袭闘京与配置在该地域的角色战斗，所以要事先配置一些主力。打倒他后本剧情完成，进入久那妓路线，全国編一开始京堂扇奈就会失踪。或者占领太刀区后选择「決戦金剛丸三蔵」打倒金剛丸，进入扇奈路线、则全国編一开始天楼久那妓就会失踪。要谨慎选择路线哦！以下是只在该路线中可以收的伙伴。
【久那妓路线】 カミラ（有五星事件） / ねこ番長（有五星事件） / マリーシア（有五星事件） / 五十嵐紅美（有五星事件）
【扇奈路线】 渡半蔵（有五星事件） / 伊織（有五星事件） / 加ヶ尾高臣（无五星事件） / ウナムル（无五星事件）
·全国编 基本情报
全国编的限制时间为99回合，进入100回合则game over。说起来有99回合，实际上时间是相当紧张的，要全部看完所有地域的事件是不可能的。如果觉得本回合实施了没有意义的指令，不要犹豫，S/L大法！
·全国编 VS PGG
全国编中，最初面对的组织应该就是PGG（Panzergruppe Gynjou）了。该组织虽然没有强力的特待生，但却拥有压倒性战力的战车部队。不过事实上，这个战车并非想象中那么难对付，只不过是外形大了一点而已……
如果有自信，也可以马上向PGG进攻，不过之前最好先占领一些闘京周边的独立势力，以积存实力。拥有在全国也首屈一指的经济力的横濱、每回合都会出现敌人、可收到有极高战力的冬摩彼方和魂塚妖姫的真宿，这两个势力最好一定要占领。
第5回合以后，斬真狼牙的好友、強力影使者久我匡一郎自动加入。其他角色的加入方法参考角色资料集。
有了相当实力以后，去找PGG的茬吧！尽管一定回合后PGG也会主动攻击过来，但我们不要浪费宝贵的时间，尽量早点攻过去比较好。
敌方的一般兵士实力普通，不过攻入树海或秋波原后，敌方主力的战车部队就会参与战斗。虽说不是非常强，但体力较多，不宜与之久战。这里可以听取斬真豪的助言，占领秋波原来使朝狗羅由真加入。只要让朝狗羅由真出战，对方的战车部队命中率就会变0。顺便说一下，戦車部隊的隊長桐原武士可以通过捕獲·説得来使其加入。
在塔鳥可以收到敌方幹部クレオ·アリパ。她不很强，可以通过速攻捕获来说得，但为了看到她的五星事件，还是在灭了PGG以后再攻击她的地盘吧。
打下敌方大本营志津岡后离胜利就只差一步了。但是，在此之前不要忘了捕获一个PGG的汎用戦闘員进行寻问，这样可以得到让敵総長銀城智香加入的重要情报。拿到情报后，占领志津岡，实施「決戦銀城智香」指令、于死亡决斗中取胜后PGG就灭掉了。
·全国編 VS ナイトメアアイズ
ナイトメアアイズ一战的剧情根据玩家走的是久那妓路线还是扇奈路线会有很大不同。在久那妓路线可以看到更多的剧情。
攻入敌方前线基地アオモリ后会出现紅飛沫大門，他有非常高的体力/攻击力，而且不能捕获、打倒后又会复活。但是，打倒3次后他就会被收监起来，不再来袭。在此状态下制压アバシリ的「刑務所」，经过一定回合后紅飛沫大門就会脱狱攻来，这时进行捕获，有シオン在的话就能说得。
占领アオモリ后，应该最優先实施「不思議な少女の噂」指令，这样シオン的事件就会陆续发生，几个回合后就可以实施「不思議な少女の館」指令使其加入。有了她，才可以使紅飛沫大門和在サッポロ出現的月臣鬼人加入。而且，シオン还是6个女主角之一。
在アバシリ有个ボーリング場，如果在灭掉ナイトメアアイズ之前先制压它，就可以实施「鉄球少女」指令。实施该指令后，森沢毬音会作为敌人出现，可以通过捕获来说得。消灭ナイトメアアイズ后该指令就不会出现。
在サッポロ出现的梶山章門跟紅飛沫大門一样会复活，但占领サッポロ以后就会死亡。该角色不能捕获加入，所以放心打吧！
