《生化奇兵3无限》中，你穿梭于3个不同的平行宇宙：
第1个宇宙是你从塔中救伊丽莎白
第2个宇宙是陈林的机器被拿走
第3个宇宙是陈林死了，VOX起义，黛西杀了芬克，布克牺牲成为烈士，伊丽莎白被夜莺捉走，你再次营救伊丽莎白
当你进入第3个宇宙时，获知属于该宇宙的伊丽莎白被转移到康斯托克宫。然后陪同你的伊丽莎白被夜莺捉走，也被押到康斯托克宫。这意味着康斯托克宫应该有两个伊丽莎白，一个是一直陪同你的伊丽莎白，一个是不认识你的伊丽莎白。
问题来了：
第一、布克与伊丽莎白袭击康斯托克宫时为什么没遇见另一个伊丽莎白?那个不认识你的伊丽莎白哪儿去了?
第二、康斯托克已经将伊丽莎白锁起来了，他和夜莺为什么还要追杀陪同你的这个伊丽莎白?
第一、 根据第3个宇宙那个成为烈士的布克的录音，在他到达哥伦比亚之前，纪念岛就已经是废墟了，这意味着，游戏最后不该出现夜莺重新毁掉纪念岛的一幕。
