10.决战JBA总部
--------过场开始--------
Hisham整合后的情报，让CIA及NSA可以对三处隐藏“红色水银”的地点展开突袭，而纽约市JBA总部的炸弹，Lambert希望由Sam就地解除，届时会设法先联络Sam，但Sam的直觉告诉他，这也将是最危险的时刻˙˙˙
回到JBA总部的Emile已派出其手下进行部署，他要Moss准备押货上船，将炸弹运到Massound手中，接著Emile转头要Sam和Jamie一起和他到拷问室，Sam的不安涌上心头，虽然Emile口口声声说如果不是Sam加入，他们抢油轮与制造“红色水银”计划，就无法那么顺利，但这不代表多疑的Emile会真正相信加入JBA才一个多月的新人，何况Massound阵营上次才逮到内奸，Emile或许也会怀疑有人渗透到JBA来，突然间，Emile的对讲机传来手下发现迅雷小组企图包围总部的迹象，Emile表面一派轻松，但他已经叫JBA全体进入备战状态；这时，三人已走到血迹斑斑的拷问室前，Emile用视网膜扫描开启了大门，Sam克制住心中怒火，面无表情地看著这名被打得半死的人--Lambert。
不！不！这不是真的！！！
“Jamie逮到了这个家伙，他在总部附近鬼鬼祟祟地好像找什么人...”Emile的眼神向利剑一般质问著Sam。
“这家伙也是CIA的人吗？”Jamie问Emile。
“我管他是CIA还是PTA，这都不重要，只要由Sam来处理就好。”Emile把枪交给Sam。
Sam觉得到手枪重量有异，里面显然只有一发子颗。
Emile离开拷问室前，又交代了一句，“Sam你有你的任务，Jamie，你也是。”
◎提示：这个抉择点是倒数三个关键的Choices Objectives之三，如果你先前两个都选JBA侧，那此时杀不杀Lambert都无法获得最佳结局。
以下的抉择后JBA信任度的变化(NSA的部分竟然没影响?!)：
［Shoot Lambert］JBA补至少25%以上
［Shoot Jamie Washington］JBA扣100%
［Shoot no one］YOU ARE THE DEAD MAN, FISHER!!
千万个念头闪过Sam的脑海，Emile识破他的身份了吗？Jamie的任务很明显，不论JBA知不知道Sam是双面间谍，仍然想藉重Sam的能力替他们完成计划的最后部分，如果Sam不杀Lambert，对Emile忠心耿耿的Jamie马上就会对Sam开枪，如果Sam要救Lambert等于是向JBA摊牌，拷问室的监视器会让他无所遁形。
Sam只有几秒钟的时间，他猛然把枪口转Jamie，砰的一声，Jamie的胸口开始流血，他到死之前都相信JBA的理念，相信Emile的每一句话，也相信Sam是能为他两肋插刀的朋友...。
“看到山姆.费雪，格杀勿论！”广播系统传来JBA总部的指令。
“...炸弹...红色水银...拆了它，若有必要，把他们全解决也可以...不计一切代价...”Lambert忍著伤口的疼痛要Sam以任务优先。
--------过场结束--------
Sam拉起Jamie的尸体，用腕表上的新软体扫描他的视网膜特征，相信对等一下要找“红色水银”所要破解的门锁有一定有帮助。Sam放下Jamie的尸体，合上他死不瞑目的双眼。
抱歉了，Jamie，为了要救Lambert，只好请你先下地狱了。
这个关卡初期，Sam除了格斗战术刀，可说是一无所有(Jamie身上的枪竟然无法抢来用！)，所以一定要小心前进；JBA的人现在都拿了重装武器，既然Sam都和JBA摊牌了，所以出了拷问室后，参考OPSAT快显画面的人物位置，见人就以各种徒手格斗放倒；JBA五名核心成员之一的Dayton在伺服器机房(Server Room)附近移动，撂倒Dayton后即可取得其视网膜特征。
往地下室暖气炉间(Furnace)走，只有一名JBA成员在那里巡逻，容易料理，之后从暖气炉间的垂直梯上到车库(Garage)，而车库对面就是射击练习场(Shooting range)。Sam想起来之前Moss在公用电脑发布的公告，提到射击练习场及高阶防护廊道(High security corridor)的军械库有放武器，现在该是去拿些家伙的时候了，闪过车库巡查的人，Sam溜进射击练习场，里面原本上锁的门就打开了，正好挂著Sam心爱的SC-20K及三视目镜。
当然，取得武器还是要步步为营，谨记随手关灯，不要和JBA成员正面冲突以节省子弹(SC-20K取得时才只有一个弹匣30发子弹，真心酸！)，公共区域(Common area)只有一个人看守，下楼后悄悄来到地雷组装区(Mine assembly area)，从有声纹锁的门进入，经楼梯井(Catwalk Stairwell)到初阶防护区(Low security corridor)，摆平此区三名JBA守卫后，来到Enrica房间对面的高阶防护廊道(High security corridor)。
当Sam心想怎么都没看到Enrica时(假设她在第8大关最后没被Sam陷害的话)，她正好从廊道走过来，两人照面，Enrica虽然已经知道Sam就是渗透者，但她仍决定要帮助你，因为Emile已经在总部的地下层，如果真的从那里引爆“红色水银”，大家都活不成；当Enrica为Sam打开需视网膜辨识才能启动的电梯门(Elevator)后，她欲言又止，Sam要Enrica躲好，他很快就会回来，至少，他自己是这么希望。(由于不能肯定等一下会遇到什么状况，既然已经到了军械库附近，没有不去A两盒弹匣及一些手榴弹的道理。)
◎提示：想取得Enrica的视网膜特征，一定要她行动不能时才能扫描
为什么恐怖组织能提供SC-20K？一直是个未解的谜团。
(USA/New York City/JAB HQ-Final Showdown，2008年3月6日23:48)
搭电梯到地下实验室层，俨然戒备森严的禁区，电梯前通道的JBA守卫都是穿防护衣，因为前面的房间就是生化武器实验室(BioLab)，解决或闪过JBA守卫后，参考3D地图进入Jamie的工作室(Jamie’s Workshop)，内有其专业背景资料，他负责制作红色水银的电子装置。
Sam从Jamie工作室后面房间下层爬到淹水区(Flooded Area)，或直接从生化武器实验室进入消除放射性污染的消毒区(Decontamination Area)，放倒守卫后，发现有扇门通往坑道，Sam小心翼翼地走在半透明的隔离走道内，终于来到隔离实验室(Laboratory)，也发现“红色水银”的确切位置，不过由于Emile已经启动它了，因此Sam只有不到十分钟的时间解决危机。
经由这个半透明的隔离走道，可进入隔离实验室。
Sam把三名穿防护衣的JBA守卫全部诱来放倒后，赶紧爬到上层技术室(Tech Room)，先以3D地图观察敌人位置，Emile站在炸弹控制前面前，但上层走道与下层走道各有一名及三名守卫，Sam要设法分别解决他们；Sam看到下层走道有个守卫落单站在阴影处，很容易从背后摸掉，这样一来，下层只剩两名守卫，再制造一点声响引其中一名过来撂倒，剩下几人就可以试著用枪狙击后，立刻变更自己的位置(如果这时Sam有电击弹就好办多了)；最后只有Emile还在做困兽之斗，Sam试图从背后冷不防勒住他，可是Emile竟挣脱了，所幸Sam技高一筹，再补上一个手刀，就击昏了Emile。
◎提示：想取得Emile的视网膜特征，一定要他行动不能时下才能扫描。
找到“红色水银”，先把操作面板破解，Sam看到内层的装置心里不禁咒骂著，时间已经这么赶了(不到3分钟)，拆除炸弹中央的雷管却一点也急不得，它和先前组装地雷的原理相同，机械手臂下降时要控制垂直与水平轴向，但更棘手的是机械手臂抓住雷管上升时也要控制垂直与水平轴向，而且容错范围更小，上升时还不可以升太慢，不然右下角的装置温度过高也会提前引爆，如果不小心撞到了，整个升降程序得再来一次；若在时限内无法解除，就会看到纽约市被夷为平地的悲剧，当然，我们的完美间谍Sam Fisher是不可能耍这种白烂的。
◎提示：以符合最佳结局(三个关键抉择中至少两个是帮NSA侧，且NSA的信任度大于33%)的进度解除炸弹成功，Sam在FBI迅雷小组攻入技术室前早就躲起来了。他悄悄起击昏了一名迅雷成员，戴上头盔，想先确认情势后再决定是否揭露自己的身份。
如果觉得垂直与水平向晃动过大，可以按“LT”摒住呼吸一段时间。
--------片尾过场开始--------
“长官，我们目前还是没有找到费雪；要占领清查这栋建筑物又要同时找这个人，我们的人手可能不足。”迅雷小组的一名队长这么说道。
“你的第一要务是去找出费雪！听懂了吗？”长官咆哮道。
* * *
“我们找到曼戴斯，他被击昏而且身上的制服及武器都被扒光了，八成是费雪所为！”迅雷小组队长急忙向长官报告。
* * *
“那至少他还活著，我们得逮到他！这附近街区已经封锁，仔细找，他逃不掉的！”长官发出紧急命令。
* * *
“长官，有小队回报已经发现他了！他目前的位置是在...噢！不，等一下他是要逃向河岸”迅雷小组队长说道。
* * *
“不论你用什么方法，千万不要让他溜掉！”长官说。
* * *
“费雪！这里是FBI，不准动！你已经被捕...”直升机上的人用扩音器吼著。
“他跳到河里去了！”暗夜之中，潜入水中的Sam很快就消失了踪影。
“开火！”直升机用探照灯来回搜索著河面，盲目射击，在黑色的河面溅起无数细小水柱。
* * *
“来不及了...他不见了”迅雷小组队长终于放弃。(后续跳接第11关)
--------片尾过场结束--------
--------如果你选择对Lambert开枪--------
当然，这不是件容易的事，Sam朝Lambert的腹部开了一枪，他应声倒地，Jamie并没有确认其是否死亡，只是放心地和Sam说他要去地下实验室找Emile。
Emile离开后，倒在血泊中的Lambert要Sam快去拆除红色水银。
“你一定要撑下去，迅雷小组就快到了！”Sam小声地说，Lambert已经失去知觉...。
不过这所换来的，只是稍微延后Sam被JBA识破的时间点，不表示他进入初阶防护区或是高阶防护廊道时不会被怀疑。其实只要你一潜入高阶防护廊道，系统就会自动把JBA的信任度降到零(这时Sam应该会觉得很对不起Lambert，他根本白挨了一枪)。
◎提示：以一般结局(三个关键抉择中只有一个是帮NSA侧，但NSA的信任度大于33%；或三个关键抉择中都帮NSA侧，但NSA的信任度小于33%)进度解除炸弹成功，在迅雷小组攻入技术室时，Sam举起双手，让迅雷小组的弟兄领他走出JBA总部，他以为事件真的已告一段落。
事实上，Sam在片尾仍然会因谋杀Lambert、恐怖活动等罪起诉，因为已经没有人能证明他的清白。虽然在审判庭上Sam主张自己无罪，但仍被收押，NSA新任的指挥官也无意为他平反，Sam只好趁押解的过程逃脱，再次成为亡命之徒...
