在开始玩家要从高斯特(Ghost)和奈奥碧(Niobe)中任选一个角色进入虚拟系统，角色之间在剧情上会有差异，不过关卡任务是相同的。在装配间选择了枪支，高斯特说出一句意味深长的话语--“过去的经验并不能被验证于末来”(Past experience can never prove the future)驾车驱驰在城市的街道上，数分钟后来到了邮局门口，根据斯帕克斯(Sparks)的提示，要寻找的邮包编号为731222。
邮局(The Post Office)
拿到钥匙后进入邮局大厅，拨枪(E键)杀掉两名警卫由柜台左侧的门进去，找到一部载物电梯。由电梯右侧的门进去(F键)，穿过走廊在拐角处找门进入有货架的房间，往左前方推门出去上楼梯，出门后来到大厅的三层平台。沿斜坡走下平台由背后杀死前面的警卫，爬过铁丝网往右到货物分检区，这里有四名警卫逐个解决掉，由前面的大门进入载物电梯，刚刚按下2层的电钮，搭档斯帕克斯提示二层布满了警察，不过已为时过晚了，当电梯的大门打开一群警察蜂拥而至。杀掉几名警察后从桌上拾到一支轻型自动步枪(SMG)，沿走廊跑到拐角，这时从左边有一辆叉车横冲过来，退后避开它杀掉两名敌人，这时叉车撞到墙壁燃起大火，消防喷头开始洒水。
往前杀掉两名箱子后的警察，在前面的箱子上有药包可拿，继续前行会遇到戴防毒面具的警察投掷瓦斯弹，主角迅速跳上货架上面寻找出路离开。接下来的行动不能跳到地面上，否则由于毒气的作用会迅速致死。首先货架顶部按逆时针方向跑过去，尽头的铁丝网可以爬到上面，往左横移落身到货架上，往前由通风管道跑过去，中途管道会断裂下去，马上起跳跃到前面的管道上，不远处就是一个平台，踢碎上面的天窗落到里面的屋子里。
出屋干掉两名警察，往前在网墙的另一侧有四名警察射击，不用理会他们跑到柱子后面恢复体力，进入一条宽阔的走廊，往前在房间内发现有很多员工在检查信件，按照斯帕克斯的提示要在附近找一间控制室。往左边跑过去翻过铁网墙到货仓，杀掉四名警察后穿过卷帘门，穿过一道门来到行政人员办公区，走到拐角往左边的隔断找门进去，穿过办公室和库房来到有控制台的房间，由两名工作人员的背后按下按钮，再由他们左侧的门离开。下铁梯后穿过一片检货区，杀掉数名警察往前翻越一道铁网墙，进入右墙的一道绿门回到一楼大厅。
进入载货电梯到二层，往前找到邮箱拿到包裹，不料这时一群警察赶到发射密集的瓦斯弹，还好奈奥碧手持霰弹枪来个美人救英雄，主角才躲过一劫。将所有的警察杀光电梯门才会打开，回到一楼大厅正要推开大门出去，结果警报响起出口被封锁，大厅里马上布满了荷枪实弹的警察，这里有很多的石柱可以藏身并恢复体力，逐个接近敌人杀掉，清除完由柜台左边的门进去，穿过数道门上楼梯来到二层平台。
平台发生断裂后接听斯帕克斯的电话，说经理室附近有电梯以可逃离。往前跳下平台到一层，到达一片着火的区域，这里是一片不小的迷宫，并且会遭遇大批的警察，敌人比较分散可以逐队清除，注意随时驻留恢复体力。穿过废墟找到一扇进去，上楼梯回到控制室穿出去，杀过一间仓库往左边进入经理室，然后按照斯帕克斯的指引由窗户飞身跃下，落到一辆货柜车上，不过计算的力道有所偏差高斯特还是掉在了地上，这时奈奥碧飞车赶至，主角跳进汽车展开一场城市飚车大追杀。
街道追杀(City Driving)
下面是纯射击单元，与《VR 战警》所不同的是这次消灭的是警察，在夜幕的掩护下，在重金属的摇滚乐中，主角疯狂地朝警车扫射，此伏彼起的警笛尖啸中但见火光冲天，轰隆爆裂声时闻于耳，掺杂在音乐节奏里甚是畅快刺激。最后汽车拐入深巷中，这回奈奥碧的驾驶技术出了点意外，高斯特被狠狠地抛出了车外
屋顶(City Rooftops)
斯帕克斯说在附近的屋顶就有电话，于是爬上木梯到屋顶平台，往前跑过去一个飞跃跳到前面楼顶，漂亮的前滚翻落地。由前面的铁梯爬上去再由波纹铁板滑到下面，继续爬一道竖梯走到一道门前，本以为可以逃出生天，结果门刚打开就被一脚踢飞，干探史密斯从里面走了出来，奈奥碧在后面开枪躲击，但都被这家伙灵巧闪开了，高斯特趁机翻身跳下这层平台。
接下来是惊险的逃亡历程，沿途会有很多复制的史密斯朝主角射击。在开始往前利用烟囱来躲避史密斯的子弹，到右前方可看到对面的竖梯，飞身跳过去爬上竖梯往右转，另一个史密斯在高处平台射击，利用柱子和矮墙来躲避子弹，往右前方向跑跳到对面屋顶，注意右侧铁网墙里还有个史密斯，迅速冲到墙后面。沿墙往右绕过去在小屋前干掉两名警察，往前跳过锈蚀的铁皮屋顶，到尽头跳到对面的废屋里。跳下去再由石块攀到对面平台，跑到尽头飞身跃上对面的竖梯，这时看到又有一个史密斯由尽头跳了下来，绕过断墙往左边闪过去，观察左下方有一间废屋，飞身跃过去跳落地面，杀掉两名警察马上上楼梯，动作慢的话会被史密斯追上。由屋顶跳过去爬竖梯，最后到达屋顶有电话的房间
机场(The Airport)
沟渠追踪(The Aqueduct)
这时一架武装直升机逼近控制塔，主角要尽快地朝它射击，射中几弹后会收到任务指令，要尽快离开控制塔顶，这时楼梯的入口已被打开，跳下楼梯与索伦会面，得知艾克塞尔已被转移到另一架运输机，于是两人夺下两辆警车朝起飞的运输机追去，结果索伦的车冲入运输机的货舱，而高斯特则尾随着飞机追过去。
接下来的熟悉一下汽车的驾驶，注意不规整的路面有很多的障碍物，如土堆、裸露的钢筋等，飞机还不时地往路面投放障碍物，对玩家的驾驶技术是很大的考验。在超过飞机后会有三辆警车追上来，尽量甩开它们，被射中的话车辆会严重受损。沿着公路继续行驶，当看到有路障标志时注意减速，左转驶进一道大门穿一道小巷，然后往左滑下斜坡进入桥洞，再往右上斜坡穿过另一座桥洞，一路开过去最后发生与对话，接着前方会出现一辆史密斯驾驶的警车，沿着一条渠道追下去关卡结束。
城下水道(The Sewers)
在虚拟世界中与队友会合，结果在逃避追杀的途中高斯特不小心由一条下水道滑了下去，接着要想办法到达顶部有电话的平台。往前沿管道走过去，贴墙边往右转，越过墙壁进入壁室继续前行，在瀑布后面爬上一道红色竖梯，沿顺时针方向跑上斜坡，到尽头往回转找楼梯上去，攀上石台爬竖梯，穿过拱门踏上管道和平台，往右侧找到两根直立的管道，在管道的后面可找到另一个竖梯。爬上去后准备战斗，杀掉两名警察往左边绕过去，找到竖梯爬到顶部天桥，在一侧找到竖井爬下去，往一侧找到有电话的吊桥不想跑过去发现大队的警察，现在使用电话还异常危险。爬回桥面后往一侧闪过去，利用建筑的掩护依次射杀分布在高低远近的四五名狙击手，这时出现任务提示，走近电话边接听来电(F键)。
在装配室选好了武器，回到吊桥上往桥头那个巨大的风扇跑过去，扔一颗手榴弹将风扇炸毁，跑上斜坡由风扇入口进入隧道，然后往右侧的竖井爬下去。往前下另一道竖梯到地窖的走廊通道，杀死一批警察往前见到墙上有“水力电站”的标牌，进门后往左转上竖梯，拨枪消灭平台远近的敌人，往前越到对面平台上，左前方有管道喷发炽热的蒸汽，由旁边的竖爬下去沿着通道顺时针跑去，遇岔路左转找到一口竖井，跳下去后往左转，尽头是一道铁管和铁丝网组成的墙壁，射杀对面的警察，往右边的木桌攀上平台，再跳到墙壁的另一侧。
往前可看到很多的圆柱体建筑，很多枪手在上面朝下射击，逐一射杀后往前在一个控制台上找到阀门，转动它可看到红色管道被关闭的动画。然后跳回地面绕到左侧找到一道竖梯爬上去，找到通道尽头的竖井跳下去。
往前行找到一个涡轮转动装置，站到它的左侧爬到顶部会触发动画，结果装置下面有炸弹被引爆，高斯特再次被摔到更低的一层大厅。往前穿过拱门和走廊，在一处围栅里找到竖梯爬上去，清楚附近的几名警察，往前走可看到对面墙上有个巨大的管道入口，右上方两位战友(Ice and Ccorrupt)站在天桥上朝下射击，下面要用手雷炸开那个管道入口，但要小心不要伤及同伴的性命，屏幕左边会多出两位同伴的生命槽，他们一旦死亡主角的任务也告失败，最后由炸开的入口离开。
跳下平台沿着散放着烟雾的锈蚀管道前行，尽头是一道风扇，往右侧拐找到竖梯爬上去，左拐过空中天桥杀掉三名过来的警察，穿过铺设管路的走廊来到四角有圆形立柱的天井，下五段楼梯来到下层的通道入口，穿出去再过一段天桥，这时会有提示说这里的光线太暗，由左侧的竖梯爬到下面，在地上找到一只手电筒，回到天桥在前面的通道出口看到一群警察朝某处迅速汇集，看来他们是前去抓捕一名战友的，尾随上去阻止他们的计划。
出通道往右转跳下水渠往前跑过去，遇到一群警察正在围袭沃斯特(Wurm)，将这群家伙清掉后看到沃斯特逃开了，身后仍有警察追随着，先不用管她。沿着水渠往另一端杀过去，两侧都分布着不少的敌人，建议循序渐进稳扎稳打，到尽头有两条岔路，左边是死路，由右边的圆形通道跑下去，一个鱼跃前扑飞过断桥，穿出前方的管道跳下去。
由起始处往左转两次看到一个管道入口，进去杀三名警察能找到一个药包。返回来继续沿水渠行进，在尽头埋伏有五六名警察，远远射杀后跑过去，由左侧的门进入一条通道。右转沿楼梯下去，正前方的门不能开启，两侧的圆形水道都通往同一地点，穿出去射杀下面的警察跳到下平台，绕到对面由红色竖梯爬下去。穿过右边的铁门过一条木板桥，注意左侧墙上的管道里有伏兵，杀掉后由木板攀入管道。
穿出管道可以看到对面的管道入口，不过距离太远不能直接跳过去。先射杀附近的枪手，往右边贴墙横移过去到达对面的管道口，再往站到入口左侧的方台上，往下跳到损坏的管道上，沿着它往右前方找到缺口跳到里面。沿着破损的管道走下去，跳入通道右转爬竖梯，右转再过一道天桥，穿出弯曲的通道末端是一个圆形的房间，两侧的铁门内都有枪手伏击，杀掉后由地中央的竖井跳下去。
由通道跑到尽头看到前面的天桥在一声
由走廊穿出一间大寝室，由尽头的门返回到大厅。往右边的门进入客厅遇到一位美妇人，在一阵拥吻之后她为高斯特打开了书架后的密道。由螺旋状的楼梯下去是个地窖，往右下石阶来到阴森的酒窖，穿出去来到一个圆形的大厅，这时一名武士出现在面前，他叫休乔(Cujo),接下来是BOSS战，由于战场开阔可利用跑动的机会来恢复体力，打掉他一半血后他会跳到上面开枪射击，同时战场上跳出两名打手，杀掉他们后休乔又跳回来打，这次将他结果后由另一端的通道离开。
前面是一片地牢区，沿通道跑到尽头是一道厚重的大门，由小窗看到奈奥碧被缚在案板上，堡主将一些粉末洒在她的身上。等堡主和打手离开后，推门进入刑讯室将奈奥碧负在肩上，这时身后两名打手出现，将他们解决后继续逃离。奈奥碧醒来后，两人搀扶着往前行进，在尽头的房间遇到被囚禁的锁匠拿到一把钥匙，用它打开牢房大门穿出去，遇到两个白衣白发的孪生兄弟，两人快速抢到一辆汽车飞驰离开城堡。
城市地下(Under the City)
又是城市街道驾车枪战，驾驶仍由奈奥碧负责，主角朝后射击追来的双胞胎兄弟，同时那些呼啸的警车也要在逼近时击爆，否则会阻扰奈奥碧的驾驶，不断地撞击车体改变行驶方向，或横亘于公路上使车辆停顿下来，本关只要在追击之下坚持到一定时间即可过关。
禅房花园(The Zen Garden)
回到基地奈奥碧并末感到些许的开怀，认为莫菲斯在的话不会很快回到这里，其中缘由她也说不清楚。晚上高斯特进入系统的花园练功，崔妮蒂(Trinity)也来到了这里，两人谈话的口吻仍是针锋相对各不相让，结果比试之下高斯特还是稍胜一筹，两人于是在花园里坐下来聊天，两人都认为救世主的出现会终结这场战争，不过这种信念也是找不到缘由的，他们只能按照自已的信仰做下去，信仰远远超越于缘由。两人醒来后崔妮蒂劝高斯特尽快找一个女朋友，高斯特推说为了修行要禁色节欲，被崔妮蒂挪谕了一番。
高速公路(The Freeway)
詹森(Jason)为了保护心爱的人而不让奈奥碧出战，在他心里始终认为人类敌不过机械王国的强大，不过奈奥碧还是决心周旋到底，然后她和高斯特一些去寻找墨菲斯。接下来仍是汽车追逐战，这一次要清除前方沿途的的警车，直到找到一辆货柜车，墨菲斯正站在上面与史密斯搏斗，汽车驶近后墨菲斯跳跃下来，又飞身扑向后面的货车，结果几辆车连续相撞，墨菲斯与救下的锁匠在火海中飞行，危急时刻救世主尼欧出现了
核电站(The Power Plant)
由天窗跳到走廊后，往走廊末端跑过去是一个有设备围栏的房间，杀掉两名敌人穿出去，爬竖梯到上层平台，往前过石梁跳下平台会收到提示，奈奥碧已经清除掉狙击手，下一步是找到发电机并毁掉它。由平台一层层跳到下面，清除很多方柱后面的警员，往右边绕过去爬平台找到一只电柜上的开关，按下开关会看到奈奥碧扔下狙击手的动画。由另一侧跳下平台，爬上两段竖梯进入建筑物的内部走廊通道。
沿走廊往前跑过去找到了奈奥碧，对话之后她跑到院落需要高斯特的火力掩护，首先要清除院落四周的狙击手，右侧平台上有两名，左边楼顶有两名，杀掉四名枪手后院落里会出现数名警察，替奈奥碧将他们全部射杀，奈奥碧这时可以跑到另一个位置了。往左边杀两名警察，由墙上的铁网爬到上面平台，杀两名警察后接到提示，这时站到阳台边沿朝庭院射击，杀掉下面的警察后奈奥碧又可以移动了。往前沿着墙上的铁条爬上两层平台，再攀越两道短墙，沿着平台一路跳下去，进入走廊后一路跑进去进来一个大厅。
注意中央的平台挡板后面会出现一排枪手，小心扫射杀光，沿着左边的回廊阳台跑动，继续杀掉中央平台的敌人，往左边的门进入走廊穿出去，再往左爬上平台到达堆放木料的地方，由墙上的铁网攀上平台再跳下去，上楼梯来到库房的另一侧清除敌人，这里有很多的木箱，其中上面有药包可拿。在墙边找到竖梯爬上去，射杀左上方平台的警察，由木板跳上平台，往前由横梁上跳下去，穿出走廊来到下一区域。
跟随着一辆运输车潜入一座车库的院落，在货柜车之间有五六名枪手分布着，注意利用货车掩藏身形逐个射杀掉院落里埋伏的枪手。进入核原料储藏库，天桥上和原料桶的后面都埋伏的敌兵，穿出这个库房进入走廊，穿出去在下一个院落上楼梯到屋顶，与飞船里的斯帕克斯通话后拿到一支榴弹枪。
由铁梯回到院落会发现有警察出入院落，一发榴弹就能结果他们。进入打开的卷帘门到走廊往右转，这里是一个有许多变压器的车间，其间有大量的警察埋伏着，这里不着重于战斗只求自保就行了，目的是穿越这庞大的迷宫到达一幢建筑的楼顶，因此在跑动中要往前面固定的方向跑，由于场景和设备极为相似，请以空中的电线杆或高建筑物为参照物，最后跑到一幢楼房外面，由一道竖梯爬上楼顶。
下一步要前往核废料仓库，进入大门后射杀大厅里的伏兵，带有红色标识的原料桶可以击爆，附近的敌人会瞬间灰飞烟灭，上阶梯到中央平台上拿
跳下卡车沿小巷往左边跑过去，找到楼梯下去穿过一条地下通道，出去到街上就可看到警局了，检查警车的后备箱拿到手雷，由警局牌子右边的胡同进入一道门，往右由轮胎店的门出去到达街道另一侧，左转进入胡同找到铁梯跑到顶端进门，由平台右侧的门进入屋里。回到街上往左侧跑过去，这时前方一辆汽车燃起大火阻住去路，往左边墙上找竖梯爬到阳台拿到榴弹枪，往前面跳到汽车另侧的街道上，继续往前跑到尽头，左边玻璃窗内会跳出一名复制人，这时沿墙边往右侧跑，攀上木箱跳入街道一直跑到尽头。
由猪肉铺推门出去往右上楼梯，中途会跳出一名复制人，出屋沿着木制平台一直往右面跑过去，跳下去沿街道到尽头左转到一间厂房，穿出去跳过桥进入大楼。上木梯沿着“EXIT”的标志一路往上跑，最后来到楼顶平台发现有很多楼房的平台都由木板相连接的，走过六块木板后由平台的小屋进去，一直上楼梯来到顶层，由平台尽头的脚手架一跃跳到教堂内部，接下来看精采刺激的动画吧。
摩天大楼(The Skyscraper)
在开始位于大楼的顶层正在施工装修的房间里，转身往窗户处跑过去会遇到两个复制的史密斯，他们是打不死的不宜缠斗，由窗边攀上木板垛跳到右侧，跑出去上楼梯会遇到另一个复制人，这时由窗户跳到外面的脚手架平台上，沿平台往前绕过去，不旦后有追兵，屋里还有个复制人朝窗外射击，没跑多远脚手架的木板坍塌了下去，高斯特与复制人都落到了下层，往前跳到窗里再由另一扇窗户跳出去。接下来要利用脚手架一路往下面跑，当没有路可走时可以尝试进入屋里，由另一侧的窗口出去，然后再找到一条脚手架平台一路跑到上层，到末端一个远跳撞碎玻璃落到屋内。与斯帕克斯通话后撞开大门来到会议室，这时退路已锁上，等复制人出现后由他撞开的墙洞来到走廊，迅速往右前方的电梯跑过去
飞船逃杀(Onboard the Logos)
这是最后紧张的射击关卡，斯帕克斯驾驶飞船逃离漫长的管道，高斯特则操纵飞船上的机枪来对付后面追袭的机械水母群，射杀的过程中注意水母的远近，集中火力跟踪并消灭最近的单位，在坚持五分钟左右斯帕克斯会尝试寻找下落的地点，飞船开始在岩洞中行进，身后仍被那些机械怪物纠缠着，最后奈奥碧决定使用E.M.P的力量来摧毁它们
