知过了多久，小伙子们醒转过来，发现不仅仅是他们，还有两个女孩，大家都被关押在房内。Josh在床边找到一个带钩子的长棍，递给隔壁的Kenny，Kenny用它按开了墙壁上的牢门开关，大家得以脱身，不过发现身上的东西全被搜走了。Stan捡起墙边一把大铁剪，剪开一个大木箱的铜锁，发现大伙儿的东西全在箱子里，但唯独少了那本编号为37号的录像带。身体虚弱的Kenny说：“Friedman肯定给我们注射了他研究的毒素，一旦我们被光照射就会发生异变！”于是大家商量后决定由两个女孩照顾受伤的Kenny在原地等候，Josh和Stan去寻找脱身的出路，尽量赶在日出前找到解毒的办法。Stan和Josh出门进入走廊里面，发现尽头高处有一个梯子，用刚才用过的那根带钩的棍子拉下梯子，而后所有人一起安全地离开了地下室。
Stan用那把大铁剪破坏了通往中庭的门锁，安顿好女孩们和受伤的Kenny，Josh与Stan赶紧往医务室走去，然而他们发现Wickson小姐已倒在血泊里。奄奄一息的护士用尽最后的气力告诉他们：“你们得赶快找到解毒剂，它在基地里……实验室……大门后……另外一个入口……花园……”Josh追问道：“Wickson小姐，基地？哪儿的大门后？”护士小姐没有解释这些，她的最后一句话是：“不要让Leonard逃走了！忘了我们吧。”
两人回到中庭，大家都思索着Wickson小姐的遗言，拼命想从这些只字片语中找到答案，但终究只觉得彼此都是一头雾水。Josh突然想起在地下室看见的那封血书，于是决定先去校园东北部紧邻食堂的学生宿舍找找线索。Kenny自告奋勇地和他一起前往。
剪断那些大铁锁，两人进入宿舍（进门后在旁边的墙壁上得到G区地图）。一间间房间搜索过去，在走廊右边的第一间房内桌子上发现一些剪报（还可得到医药箱和光盘），都是有关于一系列利弗默中学离奇失踪事件的相关报道。在女厕所可得到医药箱，在相通的男厕所中可得到补血药，走廊尽头的地上有子弹夹，而在右边最尽头的房间里可得到手雷和子弹。在通往二楼的楼道里有一尊人形雕像，Josh小心地将其收好。进入二楼往左走（在二楼的第一间寝室里可得到医药箱），是一段很脆弱的木地板走廊，小心避开那些破损处，通过这里后，往左行推倒房间的大柜子，将墙壁砸出一个大洞，进去后Josh搬起地上的一个铁皮保险箱，而Kenny则在桌面发现一份科协致Friedman的公函，上面说明了因为其研究课题无法保证安全以及和社会伦理的冲突，必须马上无条件停止此课题的研究工作。显然，气急败坏的科学家并未按照科协的要求去做。离开这里进入走廊右边的房间（可得到光盘），Josh将保险箱从房间角落破损的通风道里扔下去，然后两人回到一楼。进入大门左边的第一个间房，想看看摔破的保险箱里有些什么东西。进去后发现一个巨型怪物肉山在里面，费了好大的劲才消灭它。而后在保险箱里发现了一份所谓的基地地图以及打开图书馆秘密办公室的钥匙，此外还有一份珍贵的日记，署名是Alam。这份日记写明时间是1969年11月2日，全名是Alan Gardener的这位仁兄记载了他的种种疑惑，“创建于1899年，1902年开始正式招生的利弗默中学一直由Friedman孪生兄弟俩控制，其中Herbert依然是我们的校长，这说明他们至少有100多岁的高龄了。我找到了他们的出生证明，证实了我的猜测，他们怎么能做得永远如此年轻呢？我发现一张Herbert或是Leonard的夫妻合影（抱歉我无法分清他们两人），其中的女子很像校医务室的护士Wickson小姐。
从结婚证明上看，他们竟然是在1885年结婚的。Leonard死于一场空难，但没有人找到他的遗体甚至是飞机的残骸。我找到一些关于他们兄弟俩的研究课题的介绍，上面提到他们的研究是超前的和违背社会伦理的，而我们的中学迄今已发生了26起学生失踪事件。1890年，他们远赴非洲探险，寻找可医用的植物资源。他们在那里呆了六个月，弄回了许多前所未闻的植物品种，其中一个叫做Mortifilia的植物成为后来他们研究中的重要材料。我在他们的实验室中找到了一些恐怖的畸形人照片，这些都出自于研究基地，它就在我们中学的下面，我是通过校长的笔记找到这些的。不过他们的长生不老血清依然需要完善，照片中这些半人形生物的制造失败就说明了这一点，暴露在日光下似乎可引发某些变异。在一间房子里有一扇巨大的门，我不知道门后有些什么，但我想自己知道如何去开启它。有一些小雕像设置了机关，我曾在图书馆看见了三座，在后花园看见了一座。明天我将去看看那里面究竟有些什么……”这真是令人振奋的发现，笼罩在利弗默高中上空百余年的迷雾似乎正在一点点散去。 根据日记里的提示，Kenny和Josh决定先去图书馆找到那里的雕像。拿着刚刚得到的用以打开图书馆秘密办公室的钥匙，他们轻易地进入了目的地。在办公室里，陈列着许多校长兄弟非洲探险所收集的宝贝，而让两位男生感兴趣的是一尊小雕像，和前面得到的那尊一样，只是缺了胳膊少了脑袋。Kenny在桌子上得到强光手电一个，借助手电他发现沙发上有一本电影拷贝。
他们试图去学校礼堂放映厅看看拷贝里的内容，离开时却遇到了Walden老师。Walden先生一把抢过了Kenny手上的地图，转身就溜了，而图书馆的大门也被其在外面反锁了。迫于无奈，两人只好上楼寻找出路，令人欣喜的是，在夹层的尽头，他们得到了第三尊雕像。然后上到图书馆二楼，这里似乎被许多生化苍蝇占据了，他们消耗了许多精力才将这些天花板上的恶心敌人消灭干净（三楼进门前可得到医药箱一个，各个房间有一些子弹夹、补血药、绷带以及光盘），最后得到了一把左轮手枪作为战利品。推开一间教室里靠墙的书架，进入其后的房门到达走廊一头因锁住而无法进入的房间，在这里的桌子上得到一把钥匙（房间的柜子里有闪光雷）。使用这把钥匙打开二楼走廊大门出去，奔向学校礼堂。
在放映厅里，放映先前得到的编号为24的电影拷贝，银幕画面中出现了校长兄弟和护士Wickson小姐在实验室忙碌的情景，实验室桌子上的一张纸上出现了“Code 0582”的字样。Josh恍然大悟：“我知道进入秘密基地的密码了。”两人跑回开始从地下室爬出来的下水道口附近，在这里的一处大门外输入密码0582，大门徐徐开启，寻找多时的秘密花园出现在眼前。
