基本规则
进行游戏（在万智牌语言中被称为对战）的双方必须有各自的一副牌的组合（称作套牌，它的组成受到一些规则的限制）。在对战开始的时候双方各有20点生命（一种计分方式）。游戏的目标是，用手中的卡牌设法将对方的“生命”降至0或以下，或迫使对手牌库没有牌可抽，或利用特殊咒语使其输掉此盘游戏。(注:较早期的版本有"当玩家累积10个以上的中毒指示物,则输掉这盘游戏")
套牌的组成规则包括：
1.每副套牌至少必须包含60张卡牌；
2.在每副套牌中，除基本地外，名字相同的卡牌不允许超过4张。；
3.在正式的比赛中，另外有禁牌以及限牌的存在，禁牌禁止放入套牌，限牌只允许放入1张。
游戏进行步骤为:
1.重置阶段
2.维持阶段
3.抽牌阶段
4.战斗前的行动阶段
5.战斗阶段
6.战斗后的行动阶段
7.结束阶段 此为第五版以前的规则，从第六版开始，使用堆栈的概念来进行游戏。
回合阶段为:
1.回合开始阶段（分为三步骤 重置 维持 抽牌）
2.战斗前的行动阶段
3.战斗阶段（分为九个步骤）
4.战斗后的行动阶段5.回合结束阶段（分为两步骤）
一张万智牌通常由如下几个部分组成：
万智牌(黎明使者雷亚)
一张万智牌卡牌通常由如下几个部分组成：
卡牌名称：位于牌的左上角。施放费用：位于牌的右上角。是一组数字和符号的组合，用以表示如果你要施放这个咒语，需要准备什么类型的法术力。（有些牌有特殊的支付费用，它的说明在规则叙述上显示）。如今此用语被称为“法术力费用”或“魔法力费用”（Mana Cost）。
卡牌插画：位于牌的正中。每张卡牌都有一幅插图来给予牌手此牌“视觉上”的形象，除此之外，插图在游戏中并无用途。类别栏：位于牌的插画下方靠左的位置。万智牌此游戏中有七种基本卡牌类别：地、生物、鹏洛客(台湾玩家习惯称为‘旅法师’)、结界、神器、瞬间，以及法术。
系列标志：在类别栏右侧的标志便是“系列标志”，用以告知此牌出自哪一个系列。此外，该标志还能表示此牌的稀有程度。（金色代表稀有，银色代表非普通，黑色代表普通，自阿拉若断片 红色代表秘稀，比金色更为稀有）
文字框：用于放置这张卡牌在游戏中作用的描述（规则叙述）。在一些牌上还会有以斜体或不同的字体印刷的，关于这张牌一些叙述性的文字（背景叙述）。插画作者，版权信息及卡牌收集编号：位于牌的左下角。力量／防御力框：仅属于“生物”这个类别的牌具有，位于牌的右下角，由用斜线分开的两个数字表示，用于大体地表现出该生物的厉害程度。力量：由在斜线左侧的数字表示，描述生物在战斗中能够造成的伤害。
防御力：由在斜线右侧的数字表示，描述生物能够承受的最大伤害。当它受到的伤害数值超过了其防御力时，该生物便被置入坟墓场。卡牌边框：卡片周围的黑色或白色边框用于表示此牌出自的系列。在“核心系列”中印制的牌会拥有白色的边框，而在“扩充系列”中印制的牌会拥有黑色的边框，即使这张牌的名字相同。此外，卡牌边框还能告诉你这张牌能不能用于比赛之中：只有黑色或白色边框的牌才能用在比赛中，其他颜色边框的牌都不行
万智牌的颜色
在万智牌中，总共有五种颜色，他们分别是：白、蓝、黑、红、绿。另外，还有其它的一些牌属于“无色”。（“无色”不属于任一颜色。）
白色，正义的颜色：在万智牌的世界中，白色是法制、秩序以及组织的象征。白色的法术力蕴含在平原之中。白色主要的生物类别是士兵、僧侣和天使。白色魔法能够点醒进攻生物，使其改过自新；也可对己方的生物提供强有力的保护。
蓝色，智慧的颜色：由海岛提供的蓝色法术力流淌于诡计和狡诈之间，蓝色是计谋与操弄的颜色。蓝色法术师们通常在做出一系列令人瞠目结舌的动作之前，深思熟虑着。蓝色拥有能对付其它任何颜色的反制咒语，还有能够调整手牌的力量。蓝色的主要生物类别为法术师、虚影和龙兽。
黑色，野心的颜色：腐败的沼泽涌动着黑色的魔法。黑色，是死亡、疾病、自私及不计后果的力量的象征。黑色魔法在得到强大的威力的同时，往往得付出代价。黑色法术师们长于破坏对手的心智，以及将己方死去的生物起死回生。黑色主要的生物类别为灵俑（僵尸）、骷髅妖和吸血鬼。
红色，混沌的颜色：喷发的山脉中暗藏着红色的法术力。火焰、狂热、由巨石和岩浆组成的风暴基本就是红色咒语的主题。与蓝色的法术师截然不同的是，红色的法术师往往不会将事情考虑周全，而是做了再说。在万智牌游戏中，用到比试运气，如抛硬币，的卡牌往往是红色的。红色的主要生物类别有龙和精灵（鬼怪）。
绿色，自然的颜色：绿色法术力，表示着满溢在深邃树林间自然的脉动。绿色，是成长、生命及蛮力的颜色。绿色的生物往往蕴含着魔法的力量，在需要时能够加速事物的成长。绿色的法术在强化生物方面得心应手。绿色主要的生物类别有地精（妖精）、亚龙等。
神器和地并称作无色，而“无色”并非一种颜色。
万智牌的类别
按每张卡牌在游戏中的用处不同，可分为以下几大类，他们各自还具有不同的“副类别”。
地：在万智牌游戏中，地是魔法力来源的象征。进行对战的双方必须从各自的地中汲取足够的魔法力之后，才能使用相对应魔法力的咒语。
以下五张地牌在万智牌此游戏中被称为“基本地牌”：平原、海岛、沼泽、山脉、树林。所有的基本地牌在卡牌类别栏中会注明为“基本地”，这五张牌在套牌中不受“同名牌仅限放4张”规则的约束。
生物：万智牌中含有各种各样的生物，大到龙，小到昆虫，都在万智牌中占有一席之地。生物是降低对手生命值的有效手段。
生物还有一个“生物副类别”，用于描述生物确实的种类。目前的基本格式是“生物～（职业）/（种族）”，如“生物～人类／士兵”
神器：这是上古遗留的神秘器械，包含着一些巨大的力量。
有些神器具有“武具”此副类别。武具代表了武器、甲胄，或者其他可以让你生物利用的物品。武具必须通过“佩戴”到生物身上后才能使佩戴的生物得到增强。
结界：这是它会一直伴随着你的魔法，为你提供法术的协助。（它分为附着性结界及广泛性结界）
结界分为停留在场上，影响整个对局的“广域性结界”（Global Enchantment），和结附于每个不同的永久物上面，对其发挥作用的的“区域性结界”（Local Enchantment）。从2005年8月开始，所有的“区域性结界”都具有“灵气（Aura）”的副类别。
鹏洛客：洛温系列开始新加入的类别，鹏洛客是你可以请出来的强力伙伴。
以上这五种类别的牌，统称为“永久物牌”，因为他们使用后会停留在场上，与“用完即丢”的下面两种类别的牌不同。所有的永久物牌都只能在自己的回合中使用。
法术（巫术）：法术的用途极为广泛，既可以消灭对手的生物，又可以增强己方场面上或者手牌的优势，还可以利用法术直接将对手置于死地。值得注意的是，法术只能够在自己的回合使用。
瞬间：是一种可以在任意时间都可以使用的卡牌，包括在对手的回合。是打乱对手的计划的好帮手，使得对局充满变化。
稀有度
普通牌，这类牌在15张补充包会中出现11张，因在不同的包中，同一张牌出现频率高，被称为“普通牌”。从《出瑞斯记》开始，所有普通牌在卡牌上以黑色的系列标志印刷。在白边的版本中，通常只有十张普通牌，另加一张基本地。
非普通牌，这类牌在15张的补充包中会出现3张，较之普通牌，其出现频率略低，因此得名。从《出瑞斯记》开始，所有非普通牌在卡牌上以银色的系列标志印刷。
稀有牌，这类牌在15张的补充包中会出现1张，同一张牌出现频率极低，因此为“稀有”。从《出瑞斯记》开始，所有稀有牌在卡牌上以金色的系列标志印刷。
秘稀牌，这类牌在8包的补充包中会出现1张，出现机率极低，因此为"秘稀"。从《阿拉若断片》开始，所有秘稀牌在卡牌上以红色的系列标志印制。
闪卡
在15张一包的补充包中或75张（含30张基本地）的比赛用牌中，有时会有以1：70比例插入的“特卡”，俗称“闪卡”。闪卡较之稀有牌更为稀少，更富有收藏价值之外。自从闪卡出现后，DCI举办的各类比赛的纪念牌便都以闪卡发放。
第一张真正广泛流传的闪卡应该算是在1998年9月26日举行的《克撒传》售前现开赛中作为参赛纪念送出的《闪电龙》。而更多的闪卡则是在随后发行（98年10月）的《远古遗产》中随机插送。此时中文版本的，万智牌闪卡并未出现，在补充包中随机插入的是英文版本的闪卡。
第一个具有中文闪卡的系列是《宿敌》，于2000年发行。之前的版本——《天命之战，1999》，《玛凯迪亚，1999》插入的都是英文版本的闪卡。
第一个具有简体中文闪卡的系列是《时空转移》，于2002年发行。
万智牌补充包
牌张的收集的唯一办法就是购买补充包了。从阿拉若断片环境开始，每个补充包都会有一张稀有牌或秘稀牌、三张非普通牌、十张普通牌、一张基本地，以及一张衍生物牌或规则小帖士，总共16张卡牌，并且有一定几率的特卡（出现概率为1/51）。
普通牌，这类牌在15张补充包会中出现11张，因在不同的包中，同一张牌出现频率高，被称为“普通牌”。从《出瑞斯记》开始，所有普通牌在卡牌上以黑色的系列标志印刷。在白边的版本中，通常只有十张普通牌，另加一张基本地。
非普通牌，这类牌在15张的补充包中会出现3张，较之普通牌，其出现频率略低，因此得名。从《出瑞斯记》开始，所有非普通牌在卡牌上以银色的系列标志印刷。
稀有牌，这类牌在15张的补充包中会出现1张，同一张牌出现频率极低，因此为“稀有”。从《出瑞斯记》开始，所有稀有牌在卡牌上以金色的系列标志印刷。
特卡（俗称闪卡）：第一张真正广泛流传的闪卡应该算是在1998年9月26日举行的《克撒传》售前现开赛中作为参赛纪念送出的《闪电龙》。而更多的闪卡则是在随后发行（98年10月）的《远古遗产》中随机插送。此时中文版本的万智牌闪卡并未出现，在补充包中随机插入的是英文版本的闪卡。 第一个具有中文闪卡的系列是《宿敌》，于2000年发行。之前的版本——《天命之战，1999》，《玛凯迪亚，1999》插入的都是英文版本的闪卡。 第一个具有简体中文闪卡的系列是《大战役》的第一个子系列，《时空转移》，于2001年发行。
稀秘牌，从阿拉若断片系列开始，在新版本的万智牌补充包中还出现了稀秘牌 ，这类牌平均在每5-8包补充包中会出现一张，他将代替补充包中应有的稀有牌出现。稀秘牌比稀有牌更加稀有，效果往往也更好。 如断片系列之后的全部鹏洛客，以及稀有的传奇生物等，都属于这类卡片！
