到了这里游戏难度上升了很多，敌人数量变得非常多，而且很强，这里的宝箱也非常多，混沌魔城分为入口、中层、上层、顶层4个部分。
入口：进城后左右2条路，左边是开宝箱，右边是正确道路，迷宫还是比较简单，往右边道路走几个画面后，就来到右一个左右都有分叉路的画面，这里2边都有机关，都打开后中间就出现通路了，继续前进就会遇到慧音，剧情后加入。
这个迷宫路容易走但敌人非常难打，其中带触手的球形敌人有中断我方魔法的能力，有那种家伙在就只能先采取物理攻击，如果只有3个以内的还好，成批出现还是逃跑得好，不然很难打。深处会有独眼巨人、大恐龙、绿色海星、红色机械天使、坦克、这5种比较棘手的，单个出现还好，2个一起非常麻烦，特别是坦克，虽然它很怕冰魔法，但出现率暴高，那卧槽的全体攻击，3只一起出现基本没戏的，如果有坦克和其他敌人一起出现还是逃吧。其中前3个可以抓，都很强，而大恐龙还会掉落合成龙鳞的龙骨。其他2个是掉落某种属性伤害上升20%的首饰，感觉用处不大。
这里的墙是可以通过的，里面能捡到2块最稀有合成材料的碎片，还有一个蓝色宝箱。
中层：这里是由沙漠民宅组成的地图，又有新的敌人出现，仍然是很强，要小心对付，对策仍然是打不过就逃跑，这地方也不适合练级。这个迷宫需要在楼顶和下水道间移动来到达尽头，楼顶通过走楼梯上去（其中一个楼梯因为上面封死了过不去），下水道需要通过井来下去，感觉好坑，开始我还绕了好久，原来那井不是摆设……
其中一种机器人会掉落大感电效果的剑，可以用来对付天子（天子果然是怕雷），其他武器我只得到过一种有吸血效果的枪，忘记是啥敌人掉的了，感觉就没什么用。
中层的最后部分会有2场BOSS战
OSS：
天子
天子这次异变刚发生她就从天界飞了出去，但她不是去解决异变，而是乐在其中，19想阻止她但失败了，但不知魔城出现前她都在哪里呆，现在才出现。这次战斗的理由很简单，解决异变前的消遣，不过绯想天剧情里面她是被紫妈干掉了怎么这次面对5个人居然不怕？
作为魔城的中BOSS，天子的实力比之前几个纯粹意思性的东方角色要强很多，HP有5k，攻击力很高，而且带即死，但比起苍神缘起那时的天子，还是弱了非常多，因为防御力实在太差了，招数也不够强力。这次她有雷属性的弱点，而且是很怕那种，如果有250攻击的雷魔法或者雷剑，感电匕首什么的，能给她造成巨大伤害。战术也非常简单，集中火力快速干掉她。我队伍平均级别38级，雷属性配置，一回合就能干掉她，萃香带感电匕首用勇议的三步必杀，配合文的疾风迅雷，2次行动打了她3k多的hp，加上几个雷魔法，直接送走她，要注意的就是加强我方即时防御能力，别在出招前给她秒了就行。
クロエ
天子战后继续前进，就会见到其他主角被全力状态的クロエ干倒在地，这时候紫妈幽幽等人非常愤怒，说クロエ只会欺负弱小，灵梦和白莲也就罢了，一般般，特别是中国那种，随便虐的三流角色打赢了有啥成就感。几番话后战斗发生，对手是全力状态的クロエ。
这次的クロエHP有1w，如果前面天子战相当轻松的玩家到这里可能觉得没啥，不就以前那个最弱的二柱，HP变1W，弱点还不就是光，现在装备很牛，式神一大把，或者练到满级LV70了？你们错了，这家伙开了挂的，剧情必败的，就算你满级也会给她轻松干掉，我试着修改能力和她打，发现就算你攻击力提升到9999，也只能给她几百的伤害，HP就算有9999，她几招也能干掉你，就算最后赢了，得到的经验也是0，所以不用白费力气。
战败后发生剧情，阿求出现，道出了5人合体LSC的存在，然后加入队伍，获得一堆合成列表，然后可以往顶层前进。
上层：
这个迷宫比较大，需要通过开启齿轮来打开原本关闭的门前进，路不难走，但塔的上层敌人数量非常多，而且到了后半部分开始出现强大的敌人，如ドミニオン、ルミネッセンス和ムシュフシュ，特别前2者，能2回行动，2个在一起的时候，以刚到这里的实力，很容易被秒杀，能避则避，以后再挑战。
其中ドミニオン干掉会掉最强zun帽，而ルミネッセンス掉的是合成用的珍贵道具究极阴阳玉，ムシュフシュ会掉奇美拉之铠，是不错的装备。 走这个迷宫还是需要反复进出，先开机关，然后返回出去回复再继续前进，如此慢慢前进，到深处遇到强大的敌人先逃跑，到最终boss前练级后再回来刷装备。
顶层：
进去后有3个传送点，分别是通往真三塔的，往上走2个地图则会到达最终boss处，3个塔如果不打的话，齿轮不转，BOSS是普通状态，打完BOSS就会变成强化版的。
第1塔：
地形和第1计时塔差不多，不过地图简单很多，就一条路，一个地图，通过2次注水很快就能到最深处。在回复点前面的地图，有敌人可以刷出大恶魔，这种敌人可以收，而且掉落的冥府之铠也是不错的防具，有耐心可以在这里刷刷，反正进去就回复点。需要注意的是挂掉的话就会回到迷宫出口
这里混球敌人麻痹师又出现，叫エリートマインドフレイア，エリート就是精英的意思，这种敌人还是一样的烦，不过它们居然会掉落神枪冈古尼尔……
BOSS战：
霞朱丽
Hp变成1W，其他能力能力稍强化，但行动模式没有变化，到了这里我方战斗力也已经翻倍了，如果有去刷级的话面对她时可能都70级了，用我之前介绍的老方法和她打，要赢不难。
OSS战后，要返回出口好像只能原路返回，因为踩过回复点，所以回去的路上敌人很多，这里可以选择让队伍全灭，这样能直接回到迷宫出口，想快就直接把身上加防的装备卸下，很快的……之后的2个塔出去方法也一样。
第2塔：和真1塔一样，地形类似原第1塔，画面比真1塔多，不过不难走，和走第2塔时一样，注意有光线的地方就是门，接近看小地图也能分出来，敌人大多和真1塔差不多，其中几种有差别而已，级数够高的话没什么难度。这塔唯一机关就是最后部分需要通过点灭终点附近左边房间的灯来打开终点的铁门，不过这部分很简单，只要对照右边房间的灯来设置就行，让左右房间的灯火对称，终点的铁门就会打开。
BOSS战：
クロエ
和中层尽头拦路时完全是2个人，虽然Hp是1W，但战斗力又变回以前那样，物防较高，弱点是光，用以前对付她的方法就能轻松获胜。
第三塔：
和前面2个塔一样，就是地形改变的第3塔，画面少好多，分叉路变更加少，随便走就能到达终点，要说难点就是敌人，出现很多机器人型的敌人，物理防御比较高，部分怕电，其实这塔就是考验我方持续作战能力，不过还有逃跑这一招，所以打不过就逃吧，反正路好走，无机关，所以只要不断爬楼梯，很快就能到BOSS战。
补充：这个迷宫有个适合练级和刷油库里的地点，就是BOSS战前一个画面的4个敌人，这4个敌人都有可能刷出油库里，一次是4个，一个金属黑白和3个红魔油库里，全部击破的话有1W7的经验，运气好的时候来回一次能遇到2次，加起来就有3W4了，不比在最终boss前刷的效率低，要是运气好能收到一个就赚大了，红魔油库里有全属性星级耐性（伤害8份1），LV70还能习得1回合行动3次的技能。
这里说下技巧，根据多次尝试，发现对一个敌人反复刷遇到的几率很低，有时50多次还刷不出，但是全部砍光去踩回复点让它们刷新再砍，平均2次来回就能刷到一次油库里。
BOSS战：
四十雀音羽
同样是手下败将了已经，变成1W的Hp，前2个回合的攻击比较猛烈，用式神的全体盾防或者让一个人全肛下攻击的技能都可以，之后强化我方的防御，一个负责回复，其他全力砍就得，用神奈子的高命中全体攻击，效果很不错。这个boss的全体魔法攻击反而比她的必杀技威力高，所以就算她最后挣扎也没什么威胁。
通往最终boss的通路：
这里有敌人的就2个画面，其中第1个画面尽头处2个敌人能刷出大鸟，会掉异界之铠。
第2个画面出现很多强力敌人，机械龙、レッサードラゴン（下级龙）、アズラエル（死亡天使）等等，掉落的物品都是相当强力，部分还可以抓，等级高的时候务必来刷。最后部分2个敌人可能刷出油库里王，一个3W经验，还会掉落经验增加50%的饰品，必刷的敌人。
下面贴些敌人的图及对应的掉落物。
第7默示录，威力非常大的欧系武器，可以当最终武器用
异界之铠，可以避免摔倒，适合速度慢的角色用
飞龙之枪，对龙系效果很好，有减低吐息伤害的效果，不过龙系敌人都不是BOSs……
FF系列的创世兵器，同样是根据使用者Hp来决定威力，Hp越高威力就越高，适合西瓜和幽香的武器。
前作就出现的强力首饰，可以用于合成更强力首饰博丽头带。
龙袍，4系耐性加不错的防御力。
本作的细节研究：
关于怪的刷新：这次的怪并不是你出了地图或者回到神社就会刷新，而是当你踩上传送点的瞬间。
随机遇敌：和苍神最后一个更新补丁一样，敌人的组合变成随机的，每次逃跑重新遇上又会改变，但是却也有局限性，比如魔界5,2个敌人的组合无论怎么改变都是2个，而且种类也就来来去去那2、3个，而3个敌人的组合，就有n种变化，可能是5个也可能是单个强敌，种类7种以上。而某些需要破结界或者EX吊钩的地方，过去后的敌人是由3个或者4个组成，其中4个的组合能刷到强大的敌人或油库里。
需要吊钩和EX吊钩的地方：混沌平原、九天瀑布和冥界；EX吊钩的在魔法森林、天界和无名之丘。
全灭的惩罚：回到迷宫入口，就算你在boss战前的房间往回走，也是如此，还好敌人不会刷新。
中断存档：存档还是小心点，迷宫中直接中断游戏有可能会回到神社，这时候不要去碰魔法阵，敌人就不会刷新，所以迷宫中最后在回复点上中断比较好。
关于道具，和前作一样，装备类每种只能爆出一个，消耗掉可以再获得，素材没限制。
