主线任务：取得reaper飞船的iff
前往hawking eta星云thorne星系。
joker发现在那个reaper旁边还有另一艘飞船，也许就是之前到达的科学小队
在飞船上的工作记录中可以了解到，也许科学小队被reaper的indoctrination影响了。
名词解释：
indoctrination：reaper的一种影响和控制有机生命体思想的能力。受害者一开始会表现出头疼，幻听等症状。当reaper慢慢侵入受害人大脑后，会给与受害者暗示，让受害者按照reaper的指导行动。这种indoctrination一般需要较长的时间完成。
刚进入reaper内部，发生了一次震动。edi说reaper启动了生物力场，使得shepard被困在里面了。
往前走又遇见husk，途中两个husk刚爬上来就被一个狙击手杀了，也许那个狙击手是幸存下来的人。
往深处走，发现了狙击手的身份。居然是个geth
在这里拿到reaperiff
前进至最深处，发现geth被husk击晕了。此时要消灭reaper core
下图core是闭合起来的，此时攻击无用。同时，husk会从两边攻击，这个时候专心打husk就行了。husk攻击停止后，core也就会打开，此时再攻击core。
把core消灭掉后，shepard把geth带回了normandy。
在normandy上，miranda要求把geth交给cerberus，研究。因为之前从没有人能获取一个完整的未激活的geth。而jacob则认为应该把geth扔进太空。shepard决定先去和geth对话。geth在ai core。
前往ai core与geth对话，得知原来geth并不全是为reaper服务的，也不全是想要消灭有机生命的，那些geth被不为reaper服务的geth称为“异教徒”，而且异教徒占geth社会的比重只有5%。edi说shepard救出来的geth叫做legion。
edi说，把reaper iff装在normandy上会有风险，但是shepard没有选择，只能安装。edi要测试iff与normandy的兼容性，让shepard乘坐穿梭机（shuttle）前往下一个地点。
