第三关：特里尔，德国
（Trier， Germany）
降落到特里尔后收到Sid的通讯，他让你到九世界旅馆去找宗教领袖TracerTong.调查广场的椅子有一张数据卡，阅读后拿到市区地图。广场旁边是警局总部（SSC），由右边的胡同穿过去找到QueeQueg咖啡馆，与里面的老板交谈，他让你前往警局调查为何他与Pequod咖啡馆的诉讼案子会被拖延。在咖啡馆里还有一名黑市商人，与之交谈得知九世界旅店上面有家古董店，在里面可找到神秘的黑市商人，从他手里拿到古董店的通行密码。
离开咖啡馆在一侧的胡同找到一台ATM机，利用黑客技术可盗取600块，地上还有个井盖，里面的下水道通往黑门废墟先不用进去。沿胡同前行找到九世界旅馆，右边的墙上有一道梯子通往屋顶的停机坪。进入旅馆上楼梯用密码开门进去找到Omar商人，从他们手上可买到生物药剂。到楼下的旅店往左边的圆桌听取两个客人的谈话，得到调查武器店（NurGewehre）的任务。
由旅馆的大厅往右边走有间会议室，与Tracer Tong对话得到前往黑门实验室（BlackGateLab）救援教皇的任务，在要离开时收到Dumier发来的讯息，要你前往警局会面。出旅馆往右走是一间武器配件商店，有玻璃静音器的配件可装到武器上，悄悄打碎玻璃进去拿装备。由广场进入警局，前往证物室（Evidence）门前先用电脑解除掉里面的监视器，然后用电弧刀开锁进去，移动箱子跳上去从架子上拿到生物药剂，读取数据卡完成咖啡店老板所委托的调查任务。上楼梯到看望室与里面的Dumier谈话得到黑门实验室的密码，然后离开警局往咖啡馆覆命拿报酬。
由咖啡馆旁边胡同的水道前往黑门废墟，由梯子爬上去可看到一些巡逻的警卫，杀掉他们再利用障碍避开那只巨大机器人的炮火，往废墟建筑的左侧小巷找到一名帮手，然后一起由左侧的门进去，上楼梯沿着走廊前行找到一道石门，进去乘电梯到达实验室的走廊，往左边的门进去用电脑解除掉枪塔，或者控制枪塔干掉走廊上的守卫，由房间的风道爬到走廊的另一端找到一间办公室，在里面的柜子里有三个生物药剂，由桌上的数据卡找到控制室和实验室的密码。
沿走廊找到三道黄色激光线，用电弧刀解除掉往前面的屋子找Nicolette谈话，不但打听到教皇的消息还确认了Saman叛变的事。这时由水道返回到特里尔的警局找Dumier谈话，得到教会领地的地图，到咖啡馆找飞行员前往教会领地。
来到教会的领地与NPC谈话，得知有密道潜往领地内部。沿胡同前行找到一名叫Billy的小孩，可花钱买到一份武士分布的地图。到小巷尽头跳到垃圾箱上，往左边的平台跃上去，往前发现下面的庭院有守卫和机器人，将他们解决掉跳落庭院找水道下去。
由地下通道杀过去，往右边有激光防护，解除掉往前杀掉警卫找升降梯上去，离开房间杀掉沿途的警卫，往前炸毁火箭炮塔，接下来寻找Saman的电脑终端搜寻黑门实验室里的传送装置的数据模块。由大厅往前走有黄色的激光防护，由右侧的门上楼梯到阳台，从箱子上拿到办公室的密码，返回大厅进办公室从桌上的数据卡得到电脑的开机密码，然后使用电脑下载数据模块。完成后返回到降落点与KlaraSparks交谈，乘坐飞机返回到特里尔。
回到城区到旅馆找TracerTong询问有关JCDenton的信息，然后由地下水道前往黑门废墟实验室，在途中会发现SSC警察正与教会的武士对战，在实验室里收到Dumier的提示，得知要恢复传送站的功能，要找到并启动备用的发电机组。这时前往控制室将找到的数据模块安装到控制电脑里，再沿走廊找到前往维护室的梯子，爬进去将坏掉的发电机切断电源并启动另一台备用的，然后跑到控制室操作控制电脑启动传送站，从窗户可看到外面显现的奇观，退回走廊进入传送站前往JCDenton在南极州的基地。
第四关：南极州
（Antarctica）
大雪飘飞的南极州，不仅有企鹅栖居在这里，还有灰色人种（Gray）在这里活动。由传送点出来是一座山洞，与旁边的灰色人首领对话得知他们的伙伴被人类的教会武士捕捉去了。离开山洞往前到一座山坳，正中央是一间简易房，附近有机器人和武士在巡逻看守，利用石头的障碍潜行过去，在旁边的笼子解救出被囚禁的灰色人，然后按照BillieAdams的提示潜入到简易房里，操作里面的电脑将外面巡逻的机器人解除，从桌子上的数据卡拿到密码，利用通讯仪与BillieAdam谈话。
离开简易房进入写有“SiteX”字样的洞穴，穿过去一路杀下斜坡，沿途有大量的重甲武士和枪塔阻击，前方就是JCDenton的避难所，阅读入口处的数据卡，操作前面的控制电脑的数据模块进入建筑的内部。
要启动JCDenton超级电脑的太阳神智能系统（HeliosAI），需要启动五个数据模块才行，每开启一个会发生空间转移。在打大厅找到通讯仪与Ava谈话，然后启动大厅中央控制电脑的数据模块来到一个房间，与面前的灰色人对话，书架上有龙牙剑可拿，然后上楼梯找到第二个数据模块传送到一间办公室，在里面启动第三个数据模块传送到会议室，穿过卫生间找到第四个模块传送到工厂内部，这时会遇到BillieAdams，这时可选择杀不杀她，如果不杀的话在最后的关卡她还会出现，处理完她到前面找到第五个数据模块返回到先前的大厅之中。
与全息成像通讯仪里的JCDenton通话，然后离开这里回到外面的山谷，这里的敌人会重新布署，激战之后退回到最初的雪谷，收到Saman的通讯约定在4号简易房通话，结果进入简易房后受到了大批敌人的包围，才知道是被他算计了，杀出重围进入标志着“AbandonedBase”的废弃基地，接下来要做的是利用这里的机场返回到埃及开罗。
根据TracerTong的提示点亮灯塔须启动基地下层的发电机，在一排厂房前面的平台上是控制灯塔的控帽台，没有接能电源现在还不能操作，进入旁边的屋子找到电脑，用它可解除掉外面的炮塔。左右两边的厂房分别标有A、B字样，在A区的厂房里可找到火焰喷射器，数据卡里存有两张基地的地图，上层的办公室和寝室可以找到很多的补给装备。绕到厂房的后面在墙上找到一条风道，由此可潜入B区厂房，找到楼梯下去到基地的底层，在楼梯根部的右侧有风道可潜入牢房区域，在里面有名囚犯不用理会，如果放他出来会受到攻击。沿牢房通道找到电力供配室，启动发电机的开关恢复电力供应，这时按原路回到外面的平台，操作平台上的控制开关点亮灯塔，然后由B区厂房的二楼台球室出去到停机坪，乘飞机返回到埃及开罗。
