雷霆战机的游戏模式可以分为单人游戏，双人游戏，联机游戏和特殊模式。
特殊模式指除了人们所熟悉的单人游戏以及双人游戏外，玩家采用同时操纵两架飞机的玩法。
玩家必须先将P1与P2的键 盘设置成完全相同的，然后在游戏开始后将两架飞机同时飞到角落让他们重叠。这样重叠后火力会增强很多。
在某些比较敌人较多需要躲避子弹地方，玩家甚至依靠 强大的活力来压制，不让敌人发射出子弹。此外这种模式还产生一些新的战术，包括在危险区域让Warlock使用防护弹而让VXmk II或者Xtom来攻击等等。不过因为任何两架飞机都有速度差，因此它们不可能完全重叠，这使躲避密集的子弹的难度增加。
此外，因为是这实际上进 入的是双人模式，敌机发射的子弹会增加一倍，这也增加了游戏的困难。另外因为玩家通常会将两架飞机的重型武器键设成不同，这使操作游戏又多了一个按键，增 加了操作难度。另外一种特殊模式则是：当部分老玩家在对游戏厌倦后，开始使用不开火玩法，即不是用攻击键，只使用重型武器。Xtom因为有自卫机枪成为这种玩法的首选飞机。该玩法的挑战性非常大，深受部分玩家喜爱。
