首先想知道上集的主角去了哪处的朋友，便玩fear2一次吧(完成了游戏的朋友请不要说出来)
在上一集的事件中，由于知道幕后黑手是armacham technology corporation(简称atc)的高层，所以今次的主角michael becket便与三角洲同伴一起前去拘捕这间atc的ceo genevieve aristide。接着发生了fear1的大爆炸。因此fear2的初期是发生在fear1结局前的30分钟。
大难不死的主角被带去atc的地下秘密医院里进行手术，在游戏中可以看到不少文件说明atc捉了哪些三角洲人去做实验，当中有数名符合资格，而主角更是超班水准。由于经过这次改造，所以令becket拥有了slowmo能力，而这次改造是叫做project harbinger。经过这次改造的改造人分别有becket, griffin(不记得他是谁), fox(这个被炸成灰)和keegan(最后和主角争alma‧笑)
在游戏途中，有一幕是主角同一个叫做colonel vanek的男人在进行三段角力，第一段是踢下阴(主角够毒)、第二段是拳头、第三段是用枪爆头。这个vanek是atc的清理部队队长。
接着主角离开了医院再与同伴会合，然后去到一间学校wade elementary。这间学校实际上是atc开办，目的是为了以人工方式研究出超能力人，而由于alma也是这里的学生，所以也是研究的对象。至于研究方法主要是食药、文字讯息、外科手术等等方式来进行。期间，虽然alma是最突出一个，但也因为不稳定而被移送到小岛上(即最后舞台)继续实验。
跟着主角在某实验室中找到一直为他们提供线索的snake fist(真名忘记了)，他是atc的研究员。在这部份中，主角知道从前囚禁alma的小岛上，有一个超能力(总之是类似的东西)的增幅装置，由于现在主角也有超能力，所以用它就能消灭alma(详细请看游戏内容吧)和atc另一个计划project paragon。
然后又是经过一段路程，主角的队友keegan神经失常(在游戏中第一次控制战车上的炮台后)，而一段找他一边顺路来到从前囚禁alma的小岛still island。
来到尾段，主角在一个球体增幅器里(其实大家一早已经看过它，不知道？在最初读取游戏资料时，画面右下角的就是这个增幅器)，同时aristide又再出现并阻止stokes(那个女同伴)启动机器。在aristide射杀(还是射伤) stokes后，alma突然介入，并将主角带到异世界去。
来到结局，alma捉住主角的手摸她那个像怀孕一样的肚皮，而肚皮里传来了小孩的脉动。
end
有关游戏中提到的计划资料(简略两句)
project icarus(登场：fear1)
1973年atc进行了重力与健康(microgravity-related health problems)之间的实验，但不久便终止了。取而代之是" perseus"。
project origin(登场：fear1)
可怜萝莉alma在8岁时因为能力被发现出来，结果被带去做到深一层的研究，而研究的主管是她的父亲harlan wade。这个计划是希望以产子方式来制造出原版(prototypes)，借此研究是否可以利用dna方式将超能力移植到别人身上。接着alma分别在15岁和16岁时，生了两个男孩，分别是上集主角point man和大怀蛋paxton fettel。在最初point man被认定为失败。
接着在fettel 10岁时，alma与他进行联系(精神上)，令fettel失控并杀了很多人。其后atc终止了整个project origin并将封锁设施，以及停止了alma的生命维持装置，结果alma在6日后便死去。可是alma的精神却没有消失。接着又经过了一段时间，aristide再次开始这项研究，但却令alma的精神逃了出来，再一次与fettel连系，于是发生了fear1中的事件。到最后，由于不肖子point man的关系，导致整个秘密实验工场爆炸。
project perseus(fear1)
由于alma的问题，所以atc将焦点落在paxton fettel身上，并以一个超能力者控制大量复制战士(游戏中称为replica)。但当fettel被杀时(当然又是他的好大哥，point man所为)，所有fettel控制的replica也不能行动。 (所以说在fear2中的replica是由其他人控制)
project harbinger(fear2)
为了制造出更容易控制的超能力指挥官，于是便寻找拥有潜质的人，其中becket、griffin、fox和keegan被选上。至于失则的就是游戏中的怪人，如爬墙怪人等等。在alma逃出来后，aristide认为这个计划可以阻止到alma。
project paragon(fear2)
在wade elementary school里，利用药物、手术、讯息等方式制造出超能力者。 alma是其中的学生。 (所以说，科学家(alma的父亲)都是将良知卖给了恶魔，即使最后他失悔将女儿放出来也好)
关于结局
相信很多人也认定alma与becket神交吧。笔者相信这里暗示了，alma将会生出一个更加利害的超能力人出来。理由是paragon有杠杆的意思。在得到becket的影响下，alma的能力又再变强了。
