由于前代圣战的惨烈，只有2位圣斗士存活下来（史昂和童虎），而圣战都是每隔几百年就会爆发的。教皇史昂意识到只有88名圣斗士存在，无疑是无法应对未来更激烈的战争，如果再出现大量伤亡，会危及到圣域和雅典娜的安危。
于是史昂从上代圣战后,将更多为了成为圣斗士的少年为召集到一起,进行战争训练，将通过了训练但没有获得圣衣的少年们依然留了下来,组成了我们说的雅典娜军团。众人团结在智慧与战争女神雅典娜周围，维护大地的正义和和平，守护地球与人类，与邪恶势力和其他众神的意志觉醒者势力间的战斗。
后来，撒加篡位后，假借史昂的名义，获得了新军团的统领权和继续招募训练的计划。并想把军团慢慢转化为自己的私军。
但是这个充满危机的时代已经来临，面临与海皇和冥王的圣战，还有远古时代与人类竞争的巨人族觉醒。还有希腊神话体系下的诸神矛盾引发的冲突，这些冲突涉及到雅典娜的圣斗士。
《圣斗士星矢》中的五小强各据特色，无论是天马座的精神意志、白鸟座的极寒输出、天龙座的攻防并重、凤凰座的涅盘重生、还是仙女座的远程攻击，五大星座属性的突出也再现了原著中五大主角的特点。这其中无论是近程、远程、技能攻击，全部配以丰富的进攻技巧和招式，大大提升战斗方式与乐趣。在于敌人进行战斗时，更加真实的再现打击感，让玩家更加真实的体验到酣畅淋漓的战斗快-感。
圣斗士星矢OL中的场景都可以破坏，并且引用了非常真实的物理碰撞效果，损坏的建筑物可以对玩家和怪物造成伤害，而这也将成一种策略。另外，游戏中也有动作游戏中非常流行的QTE系统，并引入了全新的群体QTE,如漫画中三个黄金圣斗士使用的绝招“雅典娜的惊叹”，在游戏中将以群体QTE的形式出现。而玩家们发动这样的绝招，将整个圣域全部破坏也是能够实现的。
