为了快速生产与操控数量庞大的部队且发展科技与建筑基地设施，《最高指挥官2》设计多样化的快速键，让玩家能用手把轻松地圈选部队、点选之前的群组、快速寻找ACU、寻找发呆没事做的建筑与生产单位、设定部队移动路径与巡逻路线甚至跟随保护，可说是集结传统即时战略游戏该有的功能于一身，让玩家也能在家用主机享受运筹帷幄的成就感。用手把如何做到上述这些快捷功能，以下介绍相当实用的选取功能：
快捷键1：连点单一部队，可圈选画面上的同种单位。
快捷键2：按RB，可一次圈选画面上的所有部队，如果将地图视野扩大，一次能选的部队也会增加很多。
快捷键3：A键按住不放，会出现圆形的区域，利用摇杆移动圆形区域所涵盖的部队都会被选取。
快捷键4：首先开启任何一个单位的生产介面，按LB或RB可迅速在地图上的各式兵营与建筑单位切换。闲置单位会有符号表示。
快捷键5：如果之前已选定一些单位移动或攻击，操作视野扩大到卫星画面，会看见许多白色圈以及里头的数字，那些是之前选取过的群组，数字代表该群组的单位数量，点白圈就能选取该群组。
快捷键6：按下手把的左摇杆能迅速选取ACU。
快捷键7：建筑时按住X键不放且拖曳到空地，可透过这方式预约盖许多同样的建筑物。
可以设定路径点，用来巡逻、回收金属资源、连续盖房子或是战术移动。图中是设定Cybran的工程车回收地面残骸。
这是部队生产介面，下方显示按压LB或RB可快速切换其他生产单位，惊叹号代表目前闲置中，可用这种方式迅速找到想要的工程单位。
持续按压A键会出现绿色选取范围，移动绿色区域可圈选更多部队为一个群组。此外，对单一部队连点两次能选画面上的同种部队。
总共71个陆空单位已圈选且移到定点(部分单位还在后方赶路)，此时部队会自动排列且记下这个群组的内容，当切换到卫星视点时可再选取这个群组。
视点拉远成为卫星视点，可见到图中央有个数字71的白圈，只需点这个白圈就能一次选取上一张图的71个陆空单位。这种群组的选定方式虽然不若键盘方便，但已是首开先例的创举了。
透过这种方式可以很轻松的在卫星视点对各群组下达战略指令。每白圈里的数字代表该群组的单位数量。中央可见到比较小的核弹符号，那是正朝敌方飞去的核弹，正上方的敌方基地若无核弹防御飞弹，将遭受重创。
