汉森再次醒来时，巴卡雷夫博士刚给他进行了注射解毒剂，并告诉他没事了。关于这次钻探的内幕，这位研究者显然知道许多。由于石油钻探偶然释放了一种可怕的生物，出于一己私利，卡姆斯基很想利用它们达到自己的目的，而可悲的是，连他自己也不知道如何控制这种生物和可怕病毒的蔓延。
寻找阿尼什琴科
Find the Medicine Cabinet
医务室里可找到尤苏波夫的信(A Letter from Yusupov)，这封同样写给神秘集团“Gentlemen”的信件，描述了卡姆斯基进行生物武器研究的最新进展。按照信中的说法，他们已制造出了刀枪不入的生化战士以及可隐形的生物，只是控制这些可怕的生物仍旧是个难题。在桌上还有一份关于视网膜锁的记录(A Note about the Retinal Scan)，正如巴卡雷夫所说，只有找到阿尼什琴科才能进入磁场室，解除这里的无线电干扰。
重新找到鱼枪，然后出门，巴卡雷夫博士正想告诉汉森什么，却不幸惨死在寄生兽的触须之下。搜索他的尸体，找到储藏室钥匙(Storeroom Key)。沿着博士身后的路走下去，路上可重新得到霰弹枪和AK-47，走到尽头进门，这里就是储藏室。从左侧角落里的楼梯上2楼，在控制台前解除下层大门的电子锁，在身后弹药箱里找到榴弹枪M39，回到1楼，从刚刚解锁的大门进入底层走廊(The Lower Corridor)。 （保存点）
这里一片漆黑，向前走，在丁字路口碰到大型寄生兽的袭击，左转上楼，跑进唯一的门。一进入上层走廊(The Upper Corridor)就能听到激烈交战的声音，暂时不要理会，左拐进入走廊面对的门。刚进入主安全室(Main Security Room)就听到系统广播，必须杀光所有的敌人，房间的门户才会重新开放。战斗过后，在尸体上找到有趣的武器——火焰喷射器(Flamethrower)，门口书桌上有一份手令，刚好说明了这种武器的注意事项，如请不要在室外逆风时使用。
回到上层走廊，在刚才进入走廊的门口进入左手边的门。这个区域看上去比较复杂，但实际上只有唯一的通路可前进，在路尽头进门来到钻探单元(Drilling Unit)。这里已被大火毁坏了，还好电梯可正常使用，在破损的楼梯处找到阿尼什琴科对巴卡雷夫的监视报告(A Note from Anischenko about Bakharev)，然后乘电梯去上1层，到尽头跳下，在控制室触动机关灭火。回到下面，进入灭火后现出的门。
在仓库1(Storage Shed 1)找到新武器MP5，然后返回上层走廊，左转，穿过刚才发生激战的地方来到室外。（保存点）面前的直升机场通道(Heliport Access)里有一道激光束防线，蹲下小心地穿过这些警卫线，进入仓库(Storage Shed)。准备一场激战！阿尼什琴科的手下会源源不断涌来，比较好的策略是用M39远程大范围地给敌人造成伤害。
消除磁场
Deactivate the Magnetic Field
在阿尼什琴科的尸体上摘下他的眼球，（保存点）原路返回到上层走廊，再进入主安全室，用眼球扫描打开里间的门。找到关于电磁干扰仪的记录(A Note about the Magnetic Jammer)。根据文中的暗示，到房间最里面去，开枪击中3个连接设备的电线根部，破坏电磁铁。（保存点）
为安娜寻找解毒剂
Find the Antidote for Anna
昏迷不醒的安娜还漂浮在海上。忽然，一只恐怖的巨型寄生兽把她救了上来，那个怪物口中自言自语着么，然后慈爱地将安娜安置在医务室里。可是安娜附近很快也出现了“Exocel”的身影，在监视器里目睹了一切的汉森自然不能袖手旁观。
在身旁研究人员的尸体上找到电梯钥匙(An Elevator Key)，出门下楼回到底层走廊，在丁字路口左转，用钥匙打开电子门，（保存点）进入居住区电梯(Habitation Catwalk Elevator)。在士兵尸体上找到卡姆斯基的日记(A Page from Dr. Kamsky’s Diary)，博士在文中描述了某些试验样本的极端变异情形，生化酶制剂不仅对这些样本无效，反而会让它们极度兴奋。电梯停下后，出门进过天桥来到休息室(Rest Room)。这里似乎已被变异生物糟蹋得面目全非，上楼来到里屋，用油桶炸死楼梯角落里的寄生兽，之后向墙上长满了肉地方走去，结果从门前的缺口掉进了下一层……
汉森渐渐回过神，发现周围到处堆积着变异生物的尸体，身后有个士兵在拼命敲打铁门，试图从这个鬼地方逃出去。不理会他，从右侧的小路上楼。2楼的几间宿舍里有些补给，但不要试图进入走廊尽头的淋浴间(Showers)。乘坐水下电梯(Underwater Elevator)来到水下通道(Underwater Tunnel)，小心那些首次出现的隐形怪兽，进入通道尽头的大门，来到一部大型的实验室主电梯(Lab’s Main Elevator)前。经过电梯和培养皿中巨大的生化怪兽，进入电梯右侧的门，从实验室6(Lab 6)开始，接下来的几个房间直通天桥，沿着天桥一直进入卡姆斯基的实验室(Dr Kamsky’s Lab)，在试验台上得到解毒剂(Antidote)。（保存点
原路返回，在停尸间(Mortuary)拾到实验室电脑密码(Code for the Experimental Chamber PC)。在隔壁实验室的电脑上使用密码，解决桥下的僵尸，然后下去，来到工棚(Laboratory Shed)。从窄道绕出去，回到实验室6的下层，乘坐下层桥边的小电梯回到天桥上，出门，返回实验室主电梯。这时如果需要补给一下，可在中央启动电梯，解决掉突然出现的寄生兽后继续上升。电梯停下后，进入最大的那扇门。在门口的舰桥控制室(Bridge Conrol Room)合上天桥，通过码头电梯回到医务室和军火库，之后原路回到实验室主电梯。背对刚刚进来门口，向左数第2扇门跑去，半途中培养皿中的巨大怪兽会突然复苏。只有干掉它才能打开四周的门，建议使用火焰喷射器御敌。从左数第2扇门离开，（保存点）终于在净化室(Decontamination Room)见到了安娜，汉森毫不犹豫地将解毒剂注射给了安娜，自己却突然晕了过去……
寻找卡姆斯基的电脑
Find Kamsky’s Laptop
汉森醒来时，安娜已不见了，只好按照班尼特的指示，先去寻找笔记本电脑。从净化室的另一个门出去，在实验室2干掉隐形生物后，从后门再次回到实验室主电梯。接下来要重新回到居住区的淋浴间，也是变异生物积聚的地方。如果需要补给一下再上路，还是从舰桥控制室和码头电梯回去(在去军火库的路上会收到安娜的信息，她想要彻底毁掉这个地方)。从休息室重新回到居住区，在2楼尽头的淋浴间干掉敌人后，爬进角落里打开的通风口。这里通向科学家宿舍(The Scientists’ Dormitory)，卡姆斯基的笔记本就摆放在床头。
