搭电梯到地下实验室层，俨然戒备森严的禁区，电梯前通道的JBA守卫都是穿防护衣，因为前面的房间就是生化武器实验室(BioLab)，解决或闪过JBA守卫后，参考3D地图进入Jamie的工作室(Jamie’s Workshop)，内有其专业背景资料，他负责制作红色水银的电子装置。
Sam从Jamie工作室后面房间下层爬到淹水区(Flooded Area)，或直接从生化武器实验室进入消除放射性污染的消毒区(Decontamination Area)，放倒守卫后，发现有扇门通往坑道，Sam小心翼翼地走在半透明的隔离走道内，终于来到隔离实验室(Laboratory)，也发现“红色水银”的确切位置，不过由于Emile已经启动它了，因此Sam只有不到十分钟的时间解决危机。
经由这个半透明的隔离走道，可进入隔离实验室。
Sam把三名穿防护衣的JBA守卫全部诱来放倒后，赶紧爬到上层技术室(Tech Room)，先以3D地图观察敌人位置，Emile站在炸弹控制前面前，但上层走道与下层走道各有一名及三名守卫，Sam要设法分别解决他们;Sam看到下层走道有个守卫落单站在阴影处，很容易从背后摸掉，这样一来，下层只剩两名守卫，再制造一点声响引其中一名过来撂倒，剩下几人就可以试著用枪狙击后，立刻变更自己的位置(如果这时Sam有电击弹就好办多了);最后只有Emile还在做困兽之斗，Sam试图从背后冷不防勒住他，可是Emile竟挣脱了，所幸Sam技高一筹，再补上一个手刀，就击昏了Emile。
◎提示：想取得Emile的视网膜特征，一定要他行动不能时下才能扫描。
找到“红色水银”，先把操作面板破解，Sam看到内层的装置心里不禁咒骂著，时间已经这么赶了(不到3分钟)，拆除炸弹中央的雷管却一点也急不得，它和先前组装地雷的原理相同，机械手臂下降时要控制垂直与水平轴向，但更棘手的是机械手臂抓住雷管上升时也要控制垂直与水平轴向，而且容错范围更小，上升时还不可以升太慢，不然右下角的装置温度过高也会提前引爆，如果不小心撞到了，整个升降程序得再来一次;若在时限内无法解除，就会看到纽约市被夷为平地的悲剧，当然，我们的完美间谍Sam Fisher是不可能耍这种白烂的。
◎提示：以符合最佳结局(三个关键抉择中至少两个是帮NSA侧，且NSA的信任度大于33%)的进度解除炸弹成功，Sam在FBI迅雷小组攻入技术室前早就躲起来了。他悄悄起击昏了一名迅雷成员，戴上头盔，想先确认情势后再决定是否揭露自己的身份。
如果觉得垂直与水平向晃动过大，可以按“LT”摒住呼吸一段时间。
--------片尾过场开始--------
“长官，我们目前还是没有找到费雪;要占领清查这栋建筑物又要同时找这个人，我们的人手可能不足。”迅雷小组的一名队长这么说道。
“你的第一要务是去找出费雪!听懂了吗?”长官咆哮道。
* * *
“我们找到曼戴斯，他被击昏而且身上的制服及武器都被扒光了，八成是费雪所为!”迅雷小组队长急忙向长官报告。
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“那至少他还活著，我们得逮到他!这附近街区已经封锁，仔细找，他逃不掉的!”长官发出紧急命令。
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“长官，有小队回报已经发现他了!他目前的位置是在...噢!不，等一下他是要逃向河岸”迅雷小组队长说道。
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“不论你用什么方法，千万不要让他溜掉!”长官说。
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“费雪!这里是FBI，不准动!你已经被捕...”直升机上的人用扩音器吼著。
“他跳到河里去了!”暗夜之中，潜入水中的Sam很快就消失了踪影。
“开火!”直升机用探照灯来回搜索著河面，盲目射击，在黑色的河面溅起无数细小水柱。
* * *
“来不及了...他不见了”迅雷小组队长终于放弃。(后续跳接第11关)
--------片尾过场结束--------
--------如果你选择对Lambert开枪--------
当然，这不是件容易的事，Sam朝Lambert的腹部开了一枪，他应声倒地，Jamie并没有确认其是否死亡，只是放心地和Sam说他要去地下实验室找Emile。
Emile离开后，倒在血泊中的Lambert要Sam快去拆除红色水银。
“你一定要撑下去，迅雷小组就快到了!”Sam小声地说，Lambert已经失去知觉...。
不过这所换来的，只是稍微延后Sam被JBA识破的时间点，不表示他进入初阶防护区或是高阶防护廊道时不会被怀疑。其实只要你一潜入高阶防护廊道，系统就会自动把JBA的信任度降到零(这时Sam应该会觉得很对不起Lambert，他根本白挨了一枪)。
◎提示：以一般结局(三个关键抉择中只有一个是帮NSA侧，但NSA的信任度大于33%;或三个关键抉择中都帮NSA侧，但NSA的信任度小于33%)进度解除炸弹成功，在迅雷小组攻入技术室时，Sam举起双手，让迅雷小组的弟兄领他走出JBA总部，他以为事件真的已告一段落。
事实上，Sam在片尾仍然会因谋杀Lambert、恐怖活动等罪起诉，因为已经没有人能证明他的清白。虽然在审判庭上Sam主张自己无罪，但仍被收押，NSA新任的指挥官也无意为他平反，Sam只好趁押解的过程逃脱，再次成为亡命之徒...。
11.最后一击
(USA/New York City Harbor，2008年3月7日01:02 EST)
看到类似看电影散场的画面了吗?等等，先别走，虽然新闻快报都说恐怖组织的头目们已经伏法，但Moss手上还有准备运走的“红色水银”炸弹，若等到FBI及迅雷小组再调人来追，一定会来不及的，所以Sam决定自己搞定这只漏网之鱼。别以为很轻松，他还是受到十分钟内拆完炸弹的限制。
忘了说，这次Sam只要对付五个人，但他手上只有格斗战术刀、手持式超音波发射器(Ultrasonic Emitter)，Sam有点后悔抢来的SWAT武器不应该那么早丢掉，不过他目前是算是逃亡状态，带越多东西越累赘，他趁乱离开JBA总部，闪躲过迅雷小组的追捕，及时攀上正要驶离纽约港的巡逻艇，偷听到Moss及其手下的对话，他们似乎还不晓得JBA总部已经被扫荡，等他们谈话完毕各自散开时，Moss会走到二阶导航舱，下面有三个人在巡逻，而导航舱会有一人走出，这样一来，导航舱只剩Moss一人，Sam决定潜入导航舱单挑Moss，再来拆炸弹。
一阶底部有个通风狭道，Sam可以爬管入内。
先从一阶的普通船舱为中心，爬入底部通风狭道，进入第二个舱时向右边推门，这一区有直梯可达二阶导航舱，Sam谨慎地展施他的动作，希望不要引发其他人的注意，因为巡逻艇的空间太小，被他们围住很难全身而退他们即使在船外，目光也会不时从船舱窗户向内看。爬上二阶导航舱时，Sam瞄了一下Moss的动静，他专注地操舵，偶尔会检视一下“红色水银”。
Sam像流动的影子一般，左手从后方勒住Moss，右手却没有拿刀抵，或许他以为徒手就能让Moss就范，没想到Moss身子一蹲，双手反将Sam的左臂推开，Sam右手立刻劈下，Moss也及时架开，以自身的蛮力想扳倒体型较小的Sam，突然间一声金属与玻璃的闷击之声，Moss松了手，原来是Sam直接用三视目镜用力地头槌，他马上再补了一脚，迫使Moss无力地跪下来，Sam两手夹住Moss的下巴与后脑杓，左右使力一扭，终于解决掉Moss。这是Sam的第五项自由。
◎提示：想取得Moss的视网膜特征，就是现在了!
Sam发狠劲扭断Moss的脖子。
趁著船舱外的人尚未意识到导航室已被入侵，Sam把握时机解除这枚“红色水银”;偏偏此时FBI及迅雷小组已经追上这艘巡逻艇，他们的直升机不停在上空喊话，要求Sam立刻束手就擒，船舱外的恐怖份子已经与迅雷小组发生枪战，巡逻艇船尾也开始传出爆炸声响。
被Sam破解的计时器会突然跳到十秒内倒数，也就是说Sam十秒可以跑到巡逻艇外部然后跳入海中。开什么玩笑，这算是最后任务达成的大奖吗?Sam冲出导航室，奋力一跳，巡逻艇也在几声巨响后化为一团火球，把Sam推向更深更暗的水中...。
--------后记--------
不论你玩到何种结局，其实Sam Fisher都是在逃亡中，就算是最佳结局，我们也不确定Lambert是否安然无事(理论上要没事，不然玩家救人不是救假的吗?)，万一他在SWAT赶到之前就因其他原因挂了...无法马上证明Sam是自己人，致导SWAT的长官一直死命地追著Sam，这也是很有可能的。
当然，身为Fisher迷，笔者的个人意见是未必要硬接Splinter Cell: Essentials的设定，不然Lambert有个三长两短，怎么能说是最佳结局呢?传说Ubisoft根据“费雪要设法证明自己清白”的故事线，规划Splinter Cell五代，但一切都还是未定数，我们希望在未来还能看到Splinter Cell系列的精彩故事，Sam Fisher千万别那么早退休啊!
