由于基因记忆的数据库遭到破坏，谢伊的记忆序列并不完整。谢伊在跳崖之后竟出现在纽约，时间过去了20年。他正站在屋顶搜寻着罪犯……
在指定的绿圈区域用鹰眼视觉找到3名刺客，他们商量着要刺杀富兰克林。
3名刺客纷纷跑向市集，这里还是跳落到街道上追赶比较快，扑倒或刺杀一名。
余下的刺客到市集后并没有立刻动手，而是混迹于人群中掩藏身形。由于此前标识过很容易辨认他们的身份，悄悄接近一一刺杀。
就在此时，一群士兵跑来抓捕富兰克林，富兰克林一边呼救一边奔逃。谢伊从容的搜尸拿到补给，望着富兰克林逃走的方向走去……
暂时没有办法继续探索谢伊的记忆，主角从终端机上醒来，在黑妹维奥雷的提示下去见主管伯格，伯格觉得谢伊可能是有史以来最重要的刺客，从他的记忆中或能提取到非常有用的东西。
前往楼梯和维奥雷碰面，这部电梯总算是修好了。进到电梯按B选择楼层，到大厅左转进机房。
进行修理工作，这里的核心被分割成4个区域，切换圆环将光线分别投射到4个区域，修复完成，主机启动！
此时得到一份录音档案，是一个维迪奇的人协迫伯格为他的公司做事。回到楼上自己的办公室，继续探索谢伊的记忆碎片。
