第六章帝国的末日
龙洞骑士团领地
将骑士团领地和龙一起从睡梦中唤醒吧！
龙洞骑士团领地是一块完全不受到帝国管辖，完全保持中立的地区。团长尤刷是真之纹章之一的「龙之纹章」的继承人。能自由驱使龙的龙骑士，具有绝大的战斗力，要是能够争取他们加入解放军，想必战况将会发生相当大的转变呢！
听从军师马什的建议，去取得反对势力中破具实力的龙洞骑士团的帮忙[选择与龙骑士照个面吧]。韩胡与骑士团团长尤刷是旧识，他会与主角等人一同前往安铁镇西北方的龙洞骑士团领地。但是骑士团领地却布下了严密警戒，不准任何任进入。在入口处吃了闭门羹的主角众人，在无奈下只好前往安铁镇打探消息。
神秘的帝国贵族
主角一行人在安铁镇遇到了帝国贵族桑汪·德·普尔[选择两者皆可]，结果被他骗吃骗喝了一顿後逃之夭夭。他在逃走前曾说过要去骑士团领地，这就赶过去看看吧！追上他後，他会告诉主角石碑後面有通道，虽然半信半疑，但是还是进去碰碰运气吧！
宝箱：旧书第5卷黄金手套活力手套
睡着的龙，顺着桑汪所告知的通道前进，不小心掉落骑士团所饲养的龙的巢穴，同时也被米莉亚和富奇发现了。令众人不解的是，龙竟然全都睡着了！向米莉亚说明了原委，提出想与尤刷见面的请求被接受後，就穿过龙洞到龙骑士之馆，以便做进一步的了解。
把柳康叫来吧！与龙骑士团的团长尤刷见面後[选择两者皆可]，得知从数月之前，龙就突然沈睡不醒。尤刷为了唤醒众龙，一直寻找名医柳康，却不知柳康早已加入解放军了。从根据地将柳康带来後，他说龙不是生病，而是中毒了！想唤醒众龙须有3种材料。然而城中没有睡着的龙只剩下富奇的小黑和米莉亚的司喇舒而已。此时米莉亚会以司喇舒载主角们到希克之谷去摘取月下草。附带一提，城里右侧有个回复站。
宝箱：旧书第4卷（在书架上）窗户组2
此地加入的同伴
库洛依兹：在继承战争中与皇帝敌对的男子。韩胡在小队时，与他交谈就会加入。
富奇：骑着夥伴小黑的见习龙骑士。在龙洞骑士团的事件後加入。
米莉亚：骑着爱龙化雪的龙洞骑士团副团长。与尤刷一同加入解放军。
弗马：独自浪迹天涯的忍者。躲在龙骑士之馆的城墙後面。
尤刷：龙洞骑士团团长。解开飞龙的毒便会协助解放军。
月下草
月下草是由水晶核所守护，要打败它首先必须破坏环绕在水晶核四周的所有水晶。等到怪兽现出了主体之後再进一步攻击。当主体的中心现出了红玉时，只要再加把劲就行了。水晶核每改变一次外型，攻击就会更加凌厉。水晶核颇为难打，且擅长全体攻击，因此一定要有水之纹章来帮助队员恢复生命，否则很容易就挂了！
打倒水晶核後，继续往前进，终於发现了月下草。正当此时，温蒂突然出现！原来飞龙们之所以沈睡不醒就是温蒂干的好事。而他为了夺取主角的魂之纹章，召唤了令人意想不到的人物--泰托！泰托要求主角把他寄放在主角那里的魂魄之纹章交还给他[选择两者皆可]，此时泰托靠着魂之纹章带给他的力量，摆脱温蒂的控制，自杀性的自我毁灭，主角又再一次的体会痛苦的死别伤感...
宝箱：音乐组2霸主长袍金脖圈旋风封印球特效药
此地加入的同伴
梅司：锻冶屋的师匠，要让他加入，除了解放军人数必须超过90人以上，还要带他的4个弟子前去才行。
冲动的富奇
在主角回到龙骑士之馆後才知道，当主角一行人前往希克之谷时，富奇竟然单枪匹马的前往王城所在的空中庭园拿取第二项材料--黑龙兰。虽然轻而易举的找到了材料，但是在回程中却遇到温蒂，并遭到温蒂无情的攻击。
富奇但受重伤，还失去了爱骑小黑... 治好龙的毒後，尤刷会拜托韩胡照顾富奇，因为按照规定，失去龙的龙骑士必须离开龙洞。回去时米莉亚会以司喇舒龙送主角等人回去根据地[选择拜托你了]。
突袭北关
主角一行人回地根据地，看见青霞与柯斯林两人在一楼因「间谍」问题吵得不可开交，上到四楼时，北方的大富豪渥任的使者塔高特来到此地拜访。据说渥任和维多路一起被抓到摩拉毕城。
但是魔拉毕城的士兵都是接受过严格训练的士兵，以目前解放军的实力想与之抗衡，是相当困难的。因此军师马什认为训练解放军是当务之急，同意马什的建议後便回房间休息，此时马什独自来到主角的房间告诉主角，青霞和柯斯林趁主角不在时潜入帝国领地调查，发觉解放军的情报有外泄的情况，因此判定有间谍潜伏在解放军中。他并要主角明天的训练一切依照他的指挥行事[选择：好的]。
休息一晚後早马什谈话，开始训练军队。但此时马什却采取了直接攻入北关的策略，原来训练只是一个晃子，使间谍消息错误，让敌人绰手不及。此阵敌我双方兵力相差悬殊，将可轻易地攻下北关。战胜後，北关守将古里菲斯会弃械投降，只要答应他不会伤害他的部下，他便会加入解放军。
北关：进攻摩拉毕城的第一关。因马什的突袭策略成功，将可而轻易的获胜。
宝物：旧书第7卷
此地加入的同伴
塔高特：渥任家的仆人。为解救主人而前来求助於解放军。
古里菲斯：北关的守将，战争事件後即可使他加入。
马克希米安：马克希米安骑士团团长。攻下摩拉毕城後，再到北关去就会遇见他。接受他的请求，即加入解放军。
桑丘：马克希米安的随从，跟着出力协助解放军的主人一起加入。
侵入摩拉毕城攻下北关之後，马什会向古里菲斯提出以俘虏的性命作为交换条件，要他协助解放军进入摩拉毕城。其战略就是，让古里菲斯乔装为已经捕获了马什，将马什一行人带进城的诈降策略。马什算准若攻击其他城寨，卡西·哈吉将派兵支援，趁此时潜入城中救出渥任他们比较容易。因此派莱庞和韩胡领兵攻打其他城寨。
与马什分手之後，就和曾经来此刺探过一次的青霞和柯林一起组队前往渥任他们被囚的牢房。途中沿着屋顶爬行，使用吊绳前进之後，终於成功地救出渥任等人。接下来只要去和正在谒见卡西·哈吉的马什会合即可。附带一提，城堡右侧的士兵是回复站，可在此赚取金钱与经验值。
宝箱：粉红色颜料太极衣特效药针大地封印球
意想不到的援军虽然成功地救出了渥任，但若照这种情势下去，原本分开的敌兵将会结集於摩拉毕城，包围住解放军！不过靠着马什招来九都市同盟军，让帝国军将兵力转去攻打他们的策略，成功地避过了这场危机。接下来便是说服卡西加入解放军了。在秘希的劝说下，卡西终於点头。
此地加入的同伴
渥任：北方的大富豪。将他救出摩拉毕城後就会加入。
卡西·哈吉：帝国五将军之一。摩拉毕城的事件结束後，可说服他加入。
桑汪·德·普尔：自称帝国贵族，救出渥任後，再返回监狱中与他交谈就会加入。
最终决战
解放军终於要前往格雷斯达，迎向最後决战了！不过在此之前，必须要先通过陆地要塞呱哇城寨或是水上城寨--夏撒拉札。马什认为敌方必会认为解放军无船可用，因此水上城寨必疏於防范，而马休建议前去攻打水上城寨，但是船只呢？我方确实没有船只啊！马什承诺明早就可准备好500艘船，拭目以待吧！
明天就要迎向最终决战了解放军的每个人怀着复杂的思绪进入梦乡.....！一觉醒来後，立刻前往码头探查，果然500艘船备齐，再回到4楼会议室，与马什交谈，[选择：好，全军出征！]，向夏撒拉札出发！
水上城寨攻防战夏撒拉札的城主索尼是使用魔法的高手，魔法攻击十分恐怖，最好以弓箭对付，此外龙洞骑士团也很有效。此时应该以找到三名忍者，请多加利用吧！
关闭水闸在与索尼军队的战争事件中获胜後，舞台就会转移到水上城寨，夏撒拉札。此时军师会采取把油倒到水路，点火攻城的战略，因此必须先将城寨内部的水门关闭才行。水门的前面，果然有怪兽头目严阵以待。
贝壳怪是怪物的化身，只有在攻击时才会打开贝壳现出主体，生命力超强，非常难缠。由於他会连续发动雷系魔法进行攻击，所以要注意大家的体力，。
索尼·秀莲打倒贝壳怪，关闭了水门之後要立刻撤退。然而索尼·秀莲会在途中出现，质问主角对自己的所作所为做何感想，[选择两者皆可]，突然水路化成一片火海，悲愤的她会向主角挑战。索尼是魔法高手，几乎每回合皆以魔法攻击我方，最好小队後列配置一位使用水之纹章（或是流水纹章）的同伴负责回复，然後以普通攻击应付即可。
小建议：笔者建议在此地选择有光照之纹章的夥伴同行，如此在打败贝壳怪後行进间能快速的恢复全队的生命值，与索尼的战斗才不会陷入苦战。
宝箱：状元甲护身环雷鸣封印球混沌之盾特效药
此地加入的同伴
索尼·秀莲：帝国五将军之一，被俘後到根据地的牢房与她谈话！选择[希望你能加入！]再选择[即使如此也无所谓]
真正的间谍是？
出去外面一看，发生了意想不到的事！马什被刺杀倒地！犯人竟是桑彻。他在加入解放军之前就为皇帝效命，今天终於证实以前所有的间谍活动都是桑彻一手所干的。想起奥德沙的死，弗力克愤怒的举起手中长剑，打算杀死桑彻为奥德沙报仇！不过却被马什制止了，他认为现今最重要的事是进军帝都，目前不宜杀死他，以免影响士气！
最後决战之时来临！
前往帝都之路已全然没有阻碍，军师建议此时立刻进攻葛格雷斯达，选择[进军帝都] 。在格雷斯达之战前，解放军的同志们将会齐聚於大厅之中，互相鼓舞士气！就在这个时候勒柯娜会出现，告诉主角「门之一族」所有的秘密：数百年之前，因门之一族的力量曾遭到灭门之祸。当时温蒂和勒柯娜使用门之纹章逃过一劫。如今温蒂为了报灭门之仇，企图使用纹章的力量毁灭世界。
格里密欧复活
让格里密欧复活的条件有二，一是格里密欧死後，在游戏中段时，巴安必须战胜德敖；二是在最终决战之前，将一零八名同伴全部找齐。如此一来让格里密欧复活的仪式就会开始喔！一定有许多人为格里密欧的死伤心落泪吧！虽然要找齐108人很辛苦，不过只要能看到格里密欧复活，就一定要努力办到喔！
敌方人数数十万！该如何是好？
解放军决定进攻帝都，选择[好！出发！]，但帝国军再加上温蒂所召唤来的怪兽，兵力多达十万之众！勒柯娜虽欲将其消灭，但却不及温蒂的魔力。要是有另一枚真之纹章的协助的话将可达成。此时龙之纹章持有者尤刷，将会挺身助一臂之力，帮忙消灭温蒂的怪兽。如此一来便可开战了。
消灭怪兽後，敌我双方的兵力差距拉近，而守将于巴大多使用突击攻击，只要善加使用忍者调查敌方战术，应该不难打倒才对！战胜後，于巴会独自离去，接着便是进攻帝都了！
决战皇城主人公一行人在战争事件中获得胜利，终於要攻入王城了。组成最後的小队後，勇往直前冲向城里吧！然而在城的入口处会有呱哇城寨的守将艾恩·基度严阵以待，向你挑战喔！
此後还必须面对最後的敌人，所以在战斗时要尽量保留些实力，别大量消耗魔法。皇城内部果然布满敌兵，每往前推进，待命的敌军就会遽然出现！在这里就边采用等级低的魔法进行攻击，边保留体力吧！要尽可能先取得回复道具，以备头目战时使用。
黄金皇帝伯贝拉沙最後的敌人伯贝拉沙，人就在城堡最顶楼的空中庭园里。他为了防卫自己最後的领域，释放了附身於龙王剑中的霸王纹章的力量！这是最後一战了，拿出你的勇气与实力卯足全力一战吧！
伯贝拉沙化成的三头巨龙，其左边的头拥有再生的能力，若不先打倒它，势必会陷入苦战。而且此敌人擅长全体魔法攻击，队中务必要有一位负责回复的同伴。另外，魂纹章的「冥府」对他不管用，要特别注意。
宝箱：风之铠甲犄角盔力量环
帝国的终结打倒巴罗沙後，卡西及索尼、宽达等帝国将军会出现，质问昔日英勇的皇帝为何变成人人唾弃的昏君。此时温蒂出现，嘲笑战败的伯贝拉沙！愤怒的卡西挥剑相向，却被温蒂打败。眼看温蒂的魔手逼近主角····
突然魂之纹章发出光芒，拒绝了温蒂。「连你也拒绝我吗？也不肯接受我吗？」深受打击的温蒂绝望地说道。「够了！温蒂！不要再错下去了。」此时身负重伤的皇帝起身搂住温蒂。
原来皇帝的霸王纹章可以让一切魔法失效，伯贝拉沙根本不曾受到温蒂的控制！他深刻地爱着温蒂，希望藉由自己的爱情化解温蒂眼眸深处的悲伤与炽热的复仇之心，但是他却失败了，赔上大好的江山与许多人宝贵的生命。他期待主角在这块土地上建立更美好的国家，然後便抱着温蒂跳下城楼，结束生命...
结束--崭新的开始
伯贝拉沙自尽後，城堡开始崩塌，逃脱至中途时遇上帝国兵，此时维多路会留下来，接着弗利克也为了保护主角而受伤，要主角先行逃出，[选择：千万别死，弗利克]。看见皇城陷落，解放军的众人在城外高声欢呼庆祝。一代大国赤月帝国中於被击垮了。
