游戏一开始，先经过一系列自动的对话后得知老佛爷因为心爱的小狗丢了而心情不好，康熙开始为母后寻找小狗。先到皇妃宫问问皇妃关于小狗的消息，结果皇妃也不知道小狗到哪去了。没办法，只好去鉴古堂碰碰运气。鉴古堂在皇城后宫的东北方，来到鉴古堂，问问门口站着的宫女，宫女说刚刚见到过，那一定就在附近了。在旁边的一棵树下找到小狗，还给母后，皆大欢喜。
第二天清晨，康熙刚刚起来正要出门，就遇见了志远方丈。原来，山西巡抚穆尔赛大敛民财，民怨四起，可大学士勒满洪等人却说穆尔赛为官清廉，康熙这几天一直在为这件事情的真假而苦恼。细心的志远方丈发现了皇帝的苦衷，把康熙带到相国寺，以一个生动的例子劝康熙微服私访，亲自去山西走一趟，并让弟子绝空负责保护康熙的安全。
走出京城，来到皇城郊外，两人正要休息，忽然听到一女子的尖叫声，两人过去一看，原来是一个公子哥带着一伙强盗正要对一个女子使坏，康熙和绝空正要上前解救女子，不料那公子哥见势不妙逃跑了。二人将强盗杀掉，救出了女子。康熙决定回去调查一下那个公子哥的来头，于是两人又回到了京城。
回到京城，在客栈外的街上向一个老妇人打听到那位公子住在客栈附近。进入客栈的院子，来到黄公子家见到黄公子和他的手下，收拾了黄公子，康熙和a绝空继续赶路。
来到杨树林，看见一伙土匪绑走了一个少女，说是要带回去做压寨夫人。于是两人决定救出那女子。沿着小路一直走，便到了沧州城，从城的南门出来，那面有一个破旧的茶铺，向茶铺里的店小二打听土匪的事情，得知不远处有座黑风山，那里有个寨子，寨子里住的都是强盗，尤其是三个寨主飞龙，飞虎，飞豹，个个武艺高强。康熙觉得时间还早，便决定去沧州的衙门一趟。来到衙门告状，县令竟要收取高昂的费用，没有钱就不能告状，于是两人被赶了出来。两人只好来到那个女子被绑的地方看看能不能找到什么线索。在事发地点，康熙抓到一个送请帖的土匪喽罗，原来黑山寨的寨主要和绑来的女子成亲。康熙杀了那个土匪，拿到请帖，和绝空一起赶往黑山寨。
来到黑山寨，参加土匪头子的婚礼，等到土匪们喝得烂醉的时候，两人在寨子的西北角找到了那个女子，刚刚放出女子就被寨主发现，一场恶战之后，土匪向康熙说出了他们当土匪的原因，原来那些他们是无法忍受官府的压迫和剥削，被迫当起了土匪。
回到沧州城，康熙在客栈遇到了刚刚被救出了女子，女子向康熙到谢后便匆匆离去。二人再次来到衙门，将县令杀死后把沧州的事情交给了这时赶来的于成龙来办理。
康熙一行人走出沧州城，来到西南方向的桑林镇，先去旁边的破庙看看，然后继续往南走，在茶铺里得知有乞丐要打劫官府的运银车。二人决定马上去看个究竟。来到桑林镇西边的树林，康熙看到了乞丐们打劫官府银两的全过程，然后跟踪那些乞丐来到了济南城。
两人十分疲劳，决定先找个客栈住一晚。一觉醒来，小顺子和宜妃也来到了济南。先去衙门里看看，从穆尔齐那里得知济南的贪官刘都督欺压百姓，大肆贪污。为了拿到证据，康熙要去找师爷拿刘都督的账本。从东南方向出城，来到田家村的一个民房与师爷对话。师爷要康熙拿到一个铜人像才肯交出账本，没办法，康熙只好去寻找铜人像。沿着小路一直往东走，经过白云山，在白云山洞的尽头就可以找到铜人像。然后回到田家村在师爷那里拿到账本。回到济南城，去衙门把账本交给穆尔齐，然后把济南的事情委托给穆尔齐办理。然后来到城中的丐帮总舵，看见穆龙和丐帮的一伙人在鬼鬼祟祟说些什么。从丐帮总舵出来，在客栈门口又看见穆龙在和一个乞丐做什么交易。康熙心中十分疑惑，再次回到丐帮总舵，丐帮陈长老的女儿红霞把康熙当然坏人，带进了丐帮总舵。刚进丐帮总舵，官兵忽然杀到，把陈长老抓走，由于官兵太多康熙只好和红霞先去客栈躲避，在客栈里，康熙从红霞那里得知其实刘都督其实是个好人，一切都是穆尔齐设下的圈套用来诬陷刘都督的。再次来到田家村，在师爷的门口遇见几个官兵正要杀师爷。原来，康熙得到的账本是师爷替穆尔齐伪造的假帐本，穆尔齐认为师爷知道的事情太多，要杀他灭口。康熙上前救了师爷，然后从师爷那里得到了真的账本。拿着真账本来到衙门与穆尔齐对质，穆尔齐无话可说，派两个儿子穆龙穆虎来杀康熙，康熙解决掉他们后，在衙门的院子里正要杀穆尔齐，于成龙一行人赶到。康熙让人把穆尔齐压下，让于成龙处理剩下的事情。这时，宜妃和小顺子也来。三人团聚十分高兴。
从济南西门出去，沿着小路一直走，一路上，发现很多村庄只有女人没有男人。康熙深感疑惑。来到太原城，康熙决定查查这件事情。刚刚来到太原铸剑场，就发现有人喊崛山出事了，康熙一些人立刻前往掘山看个究竟。在崛山救出铁匠，杀光所有的敌人后回到铸剑场，可以从铁匠那里得到一个兵器。然后和长寿店门前的小孩对话，小孩会带康熙从一条密道前往煤窑。在煤窑里，康熙看见许多城里的男人在里面挖矿，康熙似乎明白了男人们失踪的原因了，找到太原县令穆尔赛的管家黄全得知这些煤窑都是穆尔赛的，他把城里所有的男人都抓到这里来为他挖矿。黄全不认识康熙，正要把康熙也抓来挖矿，穆尔赛的女儿穆青赶到，说要与康熙比武，如果康熙赢了就放他走。结果在比武的时候，康熙和穆青一见钟情，随后穆青自然放了康熙一行人，并和康熙相约三日后的崛山山顶见面。
康熙随后来到太原衙门，假称自己为煤商，来找穆尔赛买煤。穆尔赛开价五十万两白银，康熙只好答应并约好第二天去看货。康熙回到客栈休息，由于手中没五十万两银子，便派小顺子去偷。一个时辰过后，小顺子偷得银票归来。康熙一行便前往崛山，在崛山，穆尔赛已经带领许多的兵将等候康熙的到来。原来，穆尔赛早已知道康熙的身份，决定在崛山杀了康熙。寡不敌众，康熙只好找个山洞躲起来，但宜妃被穆尔赛的人抓去了。等到穆尔赛离去，康熙便去救宜妃。一路厮杀，救得宜妃，在山顶遇见穆尔赛，是决一死战的时候了。最终，康熙杀了穆尔赛，天下太平，贪官污吏从此消失。
