深入虎穴：调查“白盒”实验室
Victor Coste
Victor Coste是Fisher的军中战友，他也是Fisher回到美国后唯一信任的人。在逃出Price机场后，Fisher立刻拨通了挚友的电话求助。
这里有一段历史：1991年的海湾战争时期，Fisher和Coste都是“海豹”特种部队的一员，在迪瓦尼耶（Diwaniya），两人所在的小队遭遇伏击，结果Fisher被俘。Coste拒绝执行撤退命令，只身一人找到了Fisher，在空军火力支援的帮助下，两人成功从虎口中逃脱。20年后，Coste与他的前任长官成立了一家安全顾问公司，从事电磁研究的“白盒”实验室（White Box Technologies）正是他的前客户，同时也是Fisher的调查对象。得知Fisher的境遇后，Coste毫不犹豫地向老友伸出援手。
故事
为了保险起见，Fisher选择在华盛顿纪念碑下举行的大型嘉年华中与Coste见面，但到达游乐场，Fisher发现至少有3名特工在跟踪 Coste的行踪，看来他们已经预料到了Fisher首先会去找谁。
打发掉几个盯梢，两位多年未见的生死战友终于见面，简单的寒暄后，Coste 告诉Fisher，自己曾经的前客户“白盒”被一个名叫Lucius Galliad的人收购，他同时也是“黑箭”的老板，他将整个实验室的领导层全部被解雇，只留下了科研人员。大量实枪荷弹的“黑箭”佣兵，以及“白盒”正在紧锣密鼓中进行的EMP研究，使看似毫无头绪的调查工作有了明确的方向。还没有来得及感谢Coste的无私帮助，“黑箭”佣兵伪装成城市救援人员，以游乐场附近出现瓦斯泄漏为由驱散了这里的游客，准备解决掉Fisher。再度逃脱后的Fisher的下一个目标，就是“白盒”。
遗憾的是，Fisher晚来了一步
“黑箭”已经将改造完成的EMP炸弹运走，剩下的佣兵正在负责毁灭证据和屠杀参与此事的研究人员。Fisher的调查陷入了死胡同，唯一剩下的线索，就是“白盒”的新老板。Anna分析了Fisher上传的计算机数据，发现Lucius Galliad与Tom Reed私交甚密。至此，整个阴谋的管理层、执行层和支援层已经付出了水面：3E与“黑箭”实为蛇鼠一窝，然而这个阴谋的目的、实施方式以及它的执行时间究竟是什么？通过日程表交叉比对，Anna发现Reed和Galliad即将在于林肯纪念堂会面。此时总统准备给予Fisher支援，特勤局探员给了大叔一张记者证，帮助他混进会场。
黑手浮现：林肯纪念堂窃听
Megiddo
Megiddo是《定罪》中引出的一个势力遍布全世界的神秘组织，地位类似于《潜龙谍影2》中的“爱国者”。他们对全世界的政治、经济和军事有着重大的影响力，但只有极少数权贵才知道他们的存在。女总统Caldwell由于拒绝合作，而成为了他们急于铲除的对象。
故事
在林肯纪念堂的会面中，Galliad以自己是 “Megiddo的人”自居，对Reed出言不逊，他没有料到的是，Reed是Megiddo安插到美国政府高层中的一个内鬼，也是此次阴谋的执行者。 Reed离开后，Fisher将Galliad制服，并且审问到了重要的情报：“黑箭”已经在华盛顿安装了3枚足以覆盖全城的EMP，利用电磁脉冲瘫痪整个华盛顿的电力和通讯系统，具体的行动时间就在当晚！正当Fisher希望得到进一步情报时，Galliad被一名伪装成摄影师的杀手爆头，随后这名杀手也被汽车炸弹轰上了西天，一条线索彻底中断……
开场动画中的“闪前”，Anna这一枪，让游戏增加了悲剧性的宿命论色彩
