第三章：诺维利亚
刚下飞船在港口就被守备队拦截了下来，对话+2道德。然后在接待站遇到吉阿娜对话，如果有带莉亚娜一起的话这里还会有特别的剧情。
要离开韩山港继续追踪女族长贝尼西亚必须要得到一个通行证。有5种方法可以得到：一是把支线任务“诺维利亚：走私”中把走私品交给阿诺雷斯，下面韩山港的支线剧情都会消失。其余都在主线中，下面介绍。
进港后就去找阿诺雷斯要通行证，结果不欢而散。临走前跟吉阿娜对话，让你到韩山港中层酒吧去找一个名叫洛瑞其的突锐人。
到了酒吧和洛瑞其对话，要求帮他拿到放在办公室电脑里的阿诺雷斯受贿证据，得到合成体观察公司办公室的钥匙。
刚出电梯碰到士兵盘查，谈话技巧可以直接赶走少部分敌人并+8楷模/+9叛逆。消灭所有敌人后来到二楼找到证据，回去的路上和公司守卫对话+2道德，再次战斗。
出了办公室区会遇到吉阿娜，她要求把证据给洛瑞其前先和她谈谈。这时可以选择：
a、告知阿诺雷斯自己掌握了证据，得到通行证：
1、不用任何谈话技巧，证据交给阿诺雷斯，+9叛逆，EXP3656星币49333；
2、威胁要交出证据控告，再索要报酬+9叛逆，EXP3656，然后再用谈话技巧保留证据，后面仍可以进行b和c1的剧情，但经验减半且不能用刷道德值BUG；
3、说明不关心他们中间的斗争就想要个通行证，使用“魅力”EXP1828/使用“威吓”EXP3656，随后仍可以进行b和c1的剧情，但经验减半且不能用刷道德值BUG；
b、直接把证据交给洛瑞其，得到通行证，EXP3656星币500，谈话技巧额外+250星币；
c、回到酒吧先跟吉阿娜对话，答应劝服洛瑞其主动揭发阿诺雷斯的罪行。和洛瑞其对话，用5点谈话技巧迫使洛瑞其答应指证，+24楷模/+25叛逆，这里有个BUG，可反复得到红或蓝。
随后：
1、告诉吉阿娜好消息，得到通行证，阿诺雷斯被抓+8楷模，EXP3656；
2、跟阿诺雷斯说吉阿娜在调查他，阿诺雷斯和吉阿娜互射而死+25叛逆，EXP1828，从尸体上拿到通行证和守备队对话，EXP1828。然后去找洛瑞其索要报酬，可以用谈话技巧得到250星币。
3、可以先进行a2或a3再进行c1，只是经验减半。
进入车库后遭到桀斯伏击，打完后跟守备队长说明情况，被告知路上还会有大量桀斯。上战车到达“顶峰15号”研究所，一进门就会有一大群桀斯和克洛根佣兵。
随后会遇到雷克耐虫族，他们的毒液攻击有无视护盾效果。进入核心部位修复智能管理程序组，你可以花100个万用胶来修复或者手动修复。
智能程序告知要启动通往实验室区的列车，必须要修复中央反应堆的能源输送管并把室外通讯线连接好。顺序无所谓，反应堆建议先从左边上二楼干掉火箭筒兵和狙击手。
两处修复后就可以乘缆车到裂隙实验室了，来到裂隙实验室门口和维塔利斯队长对话，被告知女族长现在还在危险物质实验室并给与你去危险物质实验室的通行证，+2道德。
然后帮他抵御雷克耐虫的攻击后再对话，如果表示会全力帮他抵御雷克耐虫族则+2楷模。下面可选择：
a、去危险物质实验室发现被骗，从科学家尸体上取得密码启动净化系统杀虫。回来跟维塔利斯队长火拼，进入下层有剧情。之后通过修理室进入安全实验室，或从上层禁区一路杀进去。
b、用普通解码闯入禁区，这样做会拉响警报，所有的卫兵都会成为你的敌人，一路杀进安全实验室，也可以通过修理室进入安全实验室。
c、这是最好的路线，就是去医疗舱接到去隔离舱配药的任务，找维塔利斯队长要到进入隔离舱的许可，进入下层隔离舱。
配好药后被阿莎丽突击兵带着桀斯偷袭，回到医疗舱跟科恩博士对话+24楷模，对话技巧额外得到医疗胶。下面可以选择通过修理室秘道潜入，或进行a和b剧情。
和女族长贝尼西亚对话后开打，前期她是无敌的，只需杀掉她召唤的士兵，第一波是阿莎丽突击兵，后面两拨是桀斯，然后打败女族长贝尼西亚。
之后可以选择杀不杀虫后+24楷模/+25叛逆，但危险物质实验室的杀虫任务为必做任务，如果之前走b或c路线没做，现在必须返回做此任务。
之后乘缆车离开自动回到船上讨论总结后本章结束，最后Joker会询问是否向最高议会报告，选择汇报+2道德，先顶撞再正面解释可以同时+2楷模+2叛逆。
章节之间：三个任务完成其中之一后回神堡会有新的支线任务接。三个任务完成其中之二后，议会会传来信息，对话+2道德点，并可以展开第五章任务。
三个任务都完成后，如果主角同时和阿什丽凯登、莉亚娜搞暧昧，会发生吃醋然后来找你理论的剧情，被抛弃者的爱情线会断掉。
20级时接到的支线任务“失控的VI”请尽快完成，此为转职任务，可以升级为更高级职业。
第三章支线：
No.1 诺维利亚：走私：和韩山港广场的商店主人对话。先去港口拿货物，有数种选择：
a.把货直接交给商人。得到EXP300星币250，谈话技巧+星币250。
b.直接告诉商人你要私吞货物。随机得到一种武器子弹升级组件。
c.也可以通过谈话技巧问出谁是收货人，得到答齤案后去韩山港夹楼二楼找克洛根人英那摩达对话和他直接做交易。叛逆+2，EXP300星币500，谈话技巧额外+250星币。
d.如果你去和英那摩达对话并拒绝了他的价格后再和商人或英那摩达说要私吞货物的话，等你出港口时，英那摩达就会带着两个人进攻你，打死后得EXP375和随机装备。
e.去和港口管理员对话并交待走私事宜。得到EXP750星币200，谈话技巧+随机子弹升级组件。并得到主线任务品“通行证”。
No.2 诺维利亚：间谍：和韩山港夹楼的玛琳对话。玛琳希望你帮她窃取商业机密：
a.了解情况后拒绝帮她，+8楷模；
b.接受任务，和不远处的拉斐尔对话。
1.谈话技巧不够，被对方识破目的。回去和玛琳对话，EXP1219；
2.直接回去和玛琳对话，要求退出，+2楷模，EXP1219；
3.有9点“威吓”或12点“魅力”可完成所有对话，回去和玛琳报告，+2叛逆，EXP1828星币500，谈话技巧额外+250星币；
4.选择告密。回去和玛琳对话：
(1)坦白事实，+2楷模，EXP1828；
(2)撒谎说你的工作已经完成了，+9叛逆，EXP1828星币500，谈话技巧额外+250星币。
No.3 诺维利亚：有生命危险的博士：韩山港夹楼二楼的一个电脑里高级破解后得到任务。
去开普勒边缘星云的牛顿星系的奥塔姆星球，进入地下设施，一路上的敌人都是雇佣兵，实力还算不错。最深处会遇到剧情：
a.杀掉士兵，EXP500星币3500；b.让士兵杀掉博士，EXP500；c.用谈话技巧劝服士兵，你来处理博士，+8楷模/+9叛逆，EXP750。
如果你的心理档案选择了“唯一幸存者”，这里会有特别的剧情。地图左下角的隐藏金矿附近的生物“样子狡猾的母牛”，如果你背对它，它会不断偷你的星币。
