第一章：复仇
本小节全部为剧情关卡，因此攻略部分简略说明一下剧情。
二人一马摔下之后已经被追兵赶上，万急的关头，天空却突然降下大雨，火人被迫消失，而漂浮的女子似乎主要功能是追踪，没有战斗能力，也一起撤退了。
暂时安全了，男子告诉了BB自己的名字：Ocelot。而他的到来是因为一个人给了他两项任务，其中一项是将BB带出医院，另一项则是，让BB做回他自己——那个孤高的英雄，传奇雇佣兵，Big Boss。
Ocelot告诉BB，他九年前的同伴，Kazuhira Miller，在BB被判定为死亡的情况下还在独力奋战，直到Cipher终于找到了他。现在整个世界都想要BB死，不过有一个地方还在等待他的到来。再次建造自己的雇佣军部队，这是BB现在唯一的机会。
二人再次上马，朝着目的地而去…在前往新的母基地的路上，Ocelot给了BB新的机械左臂，BB利用充足的时间得以训练新的左手，并且调整好了状态，准备以传奇的姿态再次回归战场。
